64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0543 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  100 
 
 
196 aa  399  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  49.41 
 
 
187 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  50.96 
 
 
196 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  50.97 
 
 
1128 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  43.41 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  45.81 
 
 
200 aa  135  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  45.39 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  42.21 
 
 
190 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  45.12 
 
 
194 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  41.99 
 
 
192 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  42.21 
 
 
190 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  42.21 
 
 
190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  42.21 
 
 
190 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  40.88 
 
 
195 aa  131  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  41.56 
 
 
190 aa  131  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  42.21 
 
 
190 aa  131  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  41.56 
 
 
190 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  38.27 
 
 
191 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  42.21 
 
 
190 aa  130  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  41.56 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  41.56 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  41.56 
 
 
190 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  40.26 
 
 
195 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  44.81 
 
 
201 aa  123  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  47.77 
 
 
235 aa  123  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  40.22 
 
 
209 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  37.84 
 
 
185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  44.52 
 
 
195 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  36.46 
 
 
188 aa  117  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  37.5 
 
 
187 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  34.07 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  31.35 
 
 
183 aa  110  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  38.18 
 
 
196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  43.71 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  31.35 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  37.58 
 
 
187 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  37.58 
 
 
187 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  41.62 
 
 
232 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  35.47 
 
 
194 aa  105  4e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  40.36 
 
 
200 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  43.57 
 
 
243 aa  104  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  34.78 
 
 
188 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  37.5 
 
 
182 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  34.41 
 
 
181 aa  96.3  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  30.33 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  38.62 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  33.87 
 
 
475 aa  63.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  40.98 
 
 
187 aa  51.6  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  50.88 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
264 aa  43.9  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4520  S-adenosyl-methyltransferase MraW  27.74 
 
 
315 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35232  predicted protein  27.72 
 
 
385 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0112484  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3938  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  35.82 
 
 
693 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.791097  normal  0.0454105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1255  S-adenosyl-methyltransferase MraW  27.88 
 
 
295 aa  42.4  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00341421  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  29.17 
 
 
434 aa  42.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1436  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
231 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00774998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1338  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
244 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.482498  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.48 
 
 
302 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.29 
 
 
237 aa  41.2  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.48 
 
 
300 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.48 
 
 
300 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.48 
 
 
300 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.48 
 
 
300 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>