65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3485 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  100 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  49.4 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  45.51 
 
 		 185 aa  154  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  45.93 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  46.24 
 
 		 1128 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  39.08 
 
 		 188 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  38.83 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  46.63 
 
 		 200 aa  148  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  46.29 
 
 		 192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  43.64 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  39.36 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  44.63 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  39.36 
 
 		 190 aa  145  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  38.83 
 
 		 190 aa  144  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  39.36 
 
 		 190 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  46.89 
 
 		 200 aa  144  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  38.83 
 
 		 190 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  38.83 
 
 		 190 aa  143  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  38.83 
 
 		 190 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  38.83 
 
 		 190 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  38.83 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  38.3 
 
 		 190 aa  141  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  44.07 
 
 		 195 aa  140  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  40.11 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  38.83 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  38.69 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  43.58 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  38.22 
 
 		 195 aa  134  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  37.43 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  46.99 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  39.71 
 
 		 211 aa  127  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  46.59 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  35.64 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  35.64 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  47.18 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  34.22 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  38.65 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  34.22 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  35.98 
 
 		 181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  37.62 
 
 		 232 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  33.68 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  38.04 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  98.2  6e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  43.71 
 
 		 196 aa  94.7  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  39.42 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  37.87 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27308  predicted protein  31.68 
 
 		 247 aa  52  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  26.71 
 
 		 475 aa  48.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4929  hypothetical protein  37.18 
 
 		 255 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0726725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  44.9 
 
 		 262 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  24.03 
 
 		 208 aa  44.7  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  28.95 
 
 		 451 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1718  methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000284846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01450  predicted O-methyltransferase  33.33 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.580973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 237 aa  43.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  28.35 
 
 		 434 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  25.87 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.31 
 
 		 234 aa  42  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1076  Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II-like protein  39.22 
 
 		 176 aa  42  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 187 aa  42  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  28.17 
 
 		 316 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  51.35 
 
 		 409 aa  42  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  32.93 
 
 		 199 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.17 
 
 		 235 aa  41.2  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.126123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>