148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1718 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1718  methyltransferase type 11  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000284846 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2748  methyltransferase type 11  36.6 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  25.48 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.04 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.75 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1468  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  32.91 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.21 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.43 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.91 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3281  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 285 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  normal  0.615609 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.43 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3055  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346509  normal  0.0118845 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 288 aa  52.8  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  33.63 
 
 		 263 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.57 
 
 		 276 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 280 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3003  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.17 
 
 		 276 aa  51.6  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  39.66 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.09 
 
 		 248 aa  51.6  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.34 
 
 		 283 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  35.4 
 
 		 1014 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.7 
 
 		 277 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2716  Methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 352 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 397 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2226  hypothetical protein  30.25 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 279 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 624 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.44 
 
 		 273 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  33.33 
 
 		 268 aa  49.3  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 267 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 409 aa  48.9  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 243 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0635  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.81 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  25.16 
 
 		 298 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.22 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1099  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.17 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.729785  normal  0.0384798 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2184  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  28.32 
 
 		 355 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3469  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.508961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  29.37 
 
 		 267 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 282 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 337 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.97 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1024  Methyltransferase type 12  33.03 
 
 		 389 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 243 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  47.46 
 
 		 255 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.6 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.05 
 
 		 258 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 285 aa  45.1  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  34.09 
 
 		 258 aa  45.1  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 186 aa  45.1  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.19 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0177  hypothetical protein  36.45 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.683668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  36.11 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  21.7 
 
 		 279 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4541  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  40.91 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.54 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2861  methyltransferase type 12  30.91 
 
 		 508 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.751263  normal  0.700451 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.89 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  36.55 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0569  precorrin-6y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiE subunit  37.35 
 
 		 408 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  35.65 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  21.57 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1135  hypothetical protein  29.13 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  30.25 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3760  Methyltransferase type 11  21.7 
 
 		 279 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0288  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>