50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1321 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  380  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  65.95 
 
 
187 aa  254  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  65.95 
 
 
187 aa  254  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  51.31 
 
 
191 aa  205  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  49.47 
 
 
190 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  48.95 
 
 
190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  48.42 
 
 
190 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  48.42 
 
 
190 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  48.42 
 
 
190 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  48.42 
 
 
190 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  47.89 
 
 
190 aa  194  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  48.42 
 
 
190 aa  194  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  48.42 
 
 
190 aa  194  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  50 
 
 
190 aa  194  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  48.95 
 
 
190 aa  193  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  45.26 
 
 
195 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  45.56 
 
 
188 aa  148  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  42.16 
 
 
188 aa  147  8e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  42.02 
 
 
182 aa  143  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  38.67 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  34.86 
 
 
187 aa  131  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  42.93 
 
 
196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  40.23 
 
 
183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  39.66 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  35.14 
 
 
195 aa  124  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  40.46 
 
 
185 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  36.75 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  37.97 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  35.47 
 
 
196 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  34.83 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  39.57 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  33.68 
 
 
193 aa  111  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  33.94 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  34.41 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  31.91 
 
 
195 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  29.79 
 
 
189 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  29.79 
 
 
192 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  37.5 
 
 
196 aa  104  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  33.51 
 
 
235 aa  102  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  33.8 
 
 
201 aa  98.2  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  33.95 
 
 
243 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  28.5 
 
 
232 aa  93.2  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  31.52 
 
 
1128 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  31.32 
 
 
200 aa  88.2  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  26.98 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  29.65 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  29.45 
 
 
475 aa  58.5  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 
202 aa  42  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09010  S-adenosyl-methyltransferase MraW  30.86 
 
 
311 aa  41.2  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  27.45 
 
 
306 aa  41.2  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>