54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2381 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  100 
 
 		 232 aa  474  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  43.3 
 
 		 185 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  44.22 
 
 		 187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  38.74 
 
 		 209 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  42.79 
 
 		 189 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  40.58 
 
 		 196 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  42 
 
 		 1128 aa  125  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  36.23 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  34.67 
 
 		 188 aa  125  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  36.45 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  39.67 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  31.4 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  41.54 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  33.67 
 
 		 188 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  41.75 
 
 		 200 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  45.93 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  34.48 
 
 		 190 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  37.62 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  34.98 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  36.27 
 
 		 195 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  34.98 
 
 		 190 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  34.98 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  34.98 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  34.98 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  34.48 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  33.5 
 
 		 190 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  37.43 
 
 		 182 aa  106  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  34.48 
 
 		 190 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  32.32 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  35.78 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  32.32 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  33.68 
 
 		 196 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  34.48 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  34.48 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  32.82 
 
 		 188 aa  102  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  29.65 
 
 		 194 aa  101  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  42.31 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  37.44 
 
 		 200 aa  99.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  42.39 
 
 		 243 aa  98.6  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  41.62 
 
 		 196 aa  98.6  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  42.86 
 
 		 201 aa  97.8  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  28.5 
 
 		 187 aa  93.2  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  30.34 
 
 		 181 aa  92  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  29 
 
 		 183 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  28.5 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  39.89 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  33.52 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27308  predicted protein  38.71 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0656  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.656223  normal  0.351614 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1884  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.29 
 
 		 310 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0667  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0338996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  30.83 
 
 		 465 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  30.83 
 
 		 465 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 187 aa  41.6  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>