135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0564 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  100 
 
 		 196 aa  397  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  57.84 
 
 		 189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  54.3 
 
 		 1128 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  48.63 
 
 		 200 aa  186  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  51.65 
 
 		 200 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  48.66 
 
 		 192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  53.85 
 
 		 187 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  47.34 
 
 		 195 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  46.11 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  45.36 
 
 		 190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  43.82 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  42.94 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  55.63 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  44.26 
 
 		 182 aa  157  9e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  49.73 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  49.4 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  42.08 
 
 		 188 aa  152  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  40.12 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  40.12 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  40.68 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  40.12 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  39.53 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  38.12 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  38.12 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  38.12 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  37.57 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  39.53 
 
 		 190 aa  148  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  39.53 
 
 		 190 aa  147  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  37.57 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  40.44 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  50.96 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  38.57 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  38.76 
 
 		 188 aa  141  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  41.67 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  42.94 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  51.45 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  37.43 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  37.43 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  40.58 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  30.65 
 
 		 183 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  35.47 
 
 		 187 aa  117  9e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  30.11 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  39.89 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  32.8 
 
 		 194 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  34.34 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  36.84 
 
 		 225 aa  88.2  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  50 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  32.18 
 
 		 475 aa  61.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  28.76 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3938  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  32.32 
 
 		 693 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.791097  normal  0.0454105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.09 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  36.9 
 
 		 409 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2231  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  29.27 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000396256 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0116  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  40.32 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.889427  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  27.34 
 
 		 355 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.87 
 
 		 237 aa  48.5  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  39.34 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  45.28 
 
 		 217 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3348  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  30.53 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  30.83 
 
 		 265 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  37.88 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  35.44 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.93 
 
 		 254 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.1 
 
 		 276 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0323  protein-L-isoaspartate methyltransferase-like protein  26.06 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1003  methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00822165  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.51 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 273 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  28.05 
 
 		 289 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 		 256 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  42.42 
 
 		 249 aa  45.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8039  O-methyltransferase  28.26 
 
 		 240 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.957053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1919  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  28 
 
 		 302 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.134811  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.36 
 
 		 283 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  32.32 
 
 		 301 aa  45.1  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  36.11 
 
 		 447 aa  45.1  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0285  S-adenosyl-methyltransferase MraW  31.82 
 
 		 315 aa  44.7  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 264 aa  44.7  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 262 aa  44.7  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  23.39 
 
 		 271 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4188  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  37.31 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 246 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.1 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 276 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.1 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1310  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  36.92 
 
 		 419 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.23 
 
 		 310 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0467  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 255 aa  43.5  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1076  Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II-like protein  45.65 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1523  cobalt-precorrin-6Y C(15)-methyltransferase  31.58 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000132961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.44 
 
 		 238 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27308  predicted protein  35.35 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0557  Methyltransferase type 11  56.76 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.61 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0672  putative RNA methylase  23.18 
 
 		 282 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0633  SAM-dependent methyltransferase  28.99 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3492  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  28.93 
 
 		 248 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>