41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0280 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0280  ribonuclease HIII  100 
 
 		 294 aa  599  1e-170  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000720364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0276  ribonuclease HIII  41.49 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0565703  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2097  ribonuclease HIII  39.86 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.29581  normal  0.0623457 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0022  ribonuclease HIII  41.48 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4384  ribonuclease HIII  37.1 
 
 		 312 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00620456  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4666  ribonuclease HIII  37.56 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3244  ribonuclease HIII  37.73 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00108192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4682  ribonuclease HIII  38.03 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4798  ribonuclease HIII  37.56 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4451  ribonuclease HIII  37.56 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.680729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4300  ribonuclease HIII  37.56 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0572  ribonuclease HIII  37.56 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000381552  normal  0.255705 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4289  ribonuclease HIII  37.09 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4682  ribonuclease HIII  37.56 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0795  RNase HII  40.28 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.609688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1721  ribonuclease HIII  32.53 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0820  ribonuclease HIII  30.45 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0723  ribonuclease HIII  27.4 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1722  ribonuclease HIII  28.62 
 
 		 297 aa  85.5  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1221  ribonuclease HIII  30.43 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1199  ribonuclease HIII  30.43 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2587  ribonuclease HIII  26.76 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf243  ribonuclease HIII  26.94 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4670  ribonuclease HII  40.46 
 
 		 142 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.14616e-16 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0440  ribonuclease HIII  26.85 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1740  ribonuclease HIII  27.27 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2636  ribonuclease HIII  34.45 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0158571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  26.27 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  26.73 
 
 		 239 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  26.73 
 
 		 239 aa  52.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4669  ribonuclease HIII  37.35 
 
 		 177 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.74645e-16 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  30.3 
 
 		 213 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  30.99 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  22.43 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  29.15 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  48.94 
 
 		 246 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 219 aa  45.8  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  36.46 
 
 		 228 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  26.48 
 
 		 244 aa  43.5  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  27.81 
 
 		 205 aa  43.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  26.03 
 
 		 212 aa  42.7  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>