93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5361 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5361  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 265 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2114  anti-sigma-factor antagonist  40.68 
 
 		 618 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39314  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2087  putative PAS/PAC sensor protein  33.97 
 
 		 666 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000976195  normal  0.0252685 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11395  hypothetical protein  34.25 
 
 		 653 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  44.07 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  45.11 
 
 		 919 aa  82  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 1361 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 1370 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  40.16 
 
 		 1017 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  39.32 
 
 		 851 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1037  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.24 
 
 		 148 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  0.807046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  41.88 
 
 		 828 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2743  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.31 
 
 		 158 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158156  normal  0.043677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 1385 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2757  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.31 
 
 		 158 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2713  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.31 
 
 		 158 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.465561  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1923  stage II sporulation E family protein  35.5 
 
 		 511 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3002  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 		 148 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258436 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5245  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.82 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5156  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.82 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5537  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.82 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.82 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1390 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1390 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1390 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3283  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.373959  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8976  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.94 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 1711 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0253  putative signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00246404 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1745  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.39 
 
 		 153 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 1383 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0915  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 243 aa  53.1  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  29.77 
 
 		 148 aa  52.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0177  hypothetical protein  30.3 
 
 		 147 aa  52.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.160815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  32.17 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3337  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 		 158 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0315  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.77 
 
 		 147 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1514  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 		 127 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0502369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 		 739 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 382 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 368 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0373  anti-sigma F factor  31.25 
 
 		 146 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1629  putative signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 147 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.440853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 		 151 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.61 
 
 		 137 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2251  anti-sigma F factor  30.47 
 
 		 146 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  52.17 
 
 		 492 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 		 381 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4851  signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 		 382 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141965  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  48.08 
 
 		 381 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  48.08 
 
 		 381 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0066  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 		 132 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 488 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  26.92 
 
 		 159 aa  45.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5413  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 		 159 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1722  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  30.58 
 
 		 118 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0271292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  44.19 
 
 		 744 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2021  anti-sigma F factor  27.61 
 
 		 140 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2901  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  20.44 
 
 		 144 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00340315  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  26.19 
 
 		 159 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0408  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.06 
 
 		 137 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2306  anti-sigma F factor  26.87 
 
 		 140 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1393  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.21 
 
 		 159 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.754718 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0417  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.06 
 
 		 137 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.233306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1781  signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0396  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.06 
 
 		 137 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456804  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  26.19 
 
 		 159 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0148  Signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.332902  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1924  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 		 492 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  27.72 
 
 		 144 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 732 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  41.86 
 
 		 1663 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.56 
 
 		 1668 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 		 155 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000275353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2974  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 151 aa  42.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4143  anti-sigma F factor  26.32 
 
 		 146 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3830  anti-sigma F factor  26.32 
 
 		 146 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3814  anti-sigma F factor  26.32 
 
 		 146 aa  42.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3984  anti-sigma F factor  26.32 
 
 		 146 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4183  anti-sigma F factor  26.32 
 
 		 146 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0790038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4295  anti-sigma F factor  26.32 
 
 		 146 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2516  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 805 aa  42.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3904  anti-sigma F factor  26.32 
 
 		 146 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4095  anti-sigma F factor  26.32 
 
 		 146 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69426e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1055  anti-sigma F factor  26.32 
 
 		 146 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0411626 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4206  anti-sigma F factor  26.32 
 
 		 146 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000134887  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2977  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase  32.97 
 
 		 141 aa  42  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 500 aa  42  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>