37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1629 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1629  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 147 aa  303  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.440853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0253  putative signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00246404 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1722  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  35.65 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0271292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1393  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.754718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.86 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5361  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 		 265 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  34.94 
 
 		 1017 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3452  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1055  anti-sigma F factor  27.59 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0411626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4183  anti-sigma F factor  27.59 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0790038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  29 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4095  anti-sigma F factor  27.59 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69426e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4206  anti-sigma F factor  27.59 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000134887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3904  anti-sigma F factor  27.59 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4143  anti-sigma F factor  27.59 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3984  anti-sigma F factor  27.59 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3814  anti-sigma F factor  27.59 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4295  anti-sigma F factor  27.59 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4818  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.55 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3830  anti-sigma F factor  27.59 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386677  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 381 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  29 
 
 		 160 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 381 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  29.41 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  29.41 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  29 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0663  putative anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  25.36 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00575622  normal  0.0631773 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  29.41 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  29 
 
 		 160 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  29 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1014  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  29 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  29.41 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2700  putative signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 207 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.738661  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.19 
 
 		 381 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>