More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2251 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2251  anti-sigma F factor  100 
 
 		 146 aa  300  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0373  anti-sigma F factor  91.78 
 
 		 146 aa  281  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2772  anti-sigma F factor  78.77 
 
 		 146 aa  241  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1055  anti-sigma F factor  78.08 
 
 		 146 aa  238  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0411626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4183  anti-sigma F factor  78.08 
 
 		 146 aa  238  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0790038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4143  anti-sigma F factor  77.4 
 
 		 146 aa  238  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3984  anti-sigma F factor  77.4 
 
 		 146 aa  238  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3814  anti-sigma F factor  77.4 
 
 		 146 aa  238  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3830  anti-sigma F factor  77.4 
 
 		 146 aa  238  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4095  anti-sigma F factor  77.4 
 
 		 146 aa  238  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69426e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4295  anti-sigma F factor  77.4 
 
 		 146 aa  238  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3904  anti-sigma F factor  77.4 
 
 		 146 aa  238  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4206  anti-sigma F factor  77.4 
 
 		 146 aa  238  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000134887  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2021  anti-sigma F factor  61.76 
 
 		 140 aa  179  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2306  anti-sigma F factor  61.03 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  54.86 
 
 		 149 aa  166  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1662  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  57.55 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.503488  normal  0.167313 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2285  anti-sigma F factor  56.62 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0477  anti-sigma F factor  57.97 
 
 		 157 aa  155  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.899963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1558  anti-sigma F factor  57.14 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1745  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  55.22 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1681  anti-sigma F factor  58.99 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  48.94 
 
 		 148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3441  anti-sigma F factor  45.99 
 
 		 145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2065  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.97 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  43.97 
 
 		 148 aa  124  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0862  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.36 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1104  anti-sigma F factor  44.85 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.860331  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1225  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.28 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00856956  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07010  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.85 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  32.59 
 
 		 162 aa  67  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0911  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 		 290 aa  61.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  29.05 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  29.05 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  30.87 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  29.23 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0334  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1323  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  24.48 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  24.48 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  24.48 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4414  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 506 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3799  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000337486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  24.48 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  23.78 
 
 		 160 aa  52  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1964  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 427 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  normal  0.092514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  23.78 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  23.78 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  23.78 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1486  histidine kinase  29.29 
 
 		 473 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 655 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  23.78 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 1226 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  31.52 
 
 		 313 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4972  ATP-binding region, ATPase-like  27.05 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  23.78 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0315  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1673  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 1361 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3338  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 762 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3187  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  22.95 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00310168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 560 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3250  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 488 aa  48.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1360  cellulose binding, type IV  33.33 
 
 		 544 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2317  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.68 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.128595  normal  0.13523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 781 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0664  Signal transduction histidine kinase-like protein  27 
 
 		 543 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 779 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2488  putative anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  29.51 
 
 		 129 aa  47.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  35.71 
 
 		 309 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0179  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3337  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.08 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2901  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00340315  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 632 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0932  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 632 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2469  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.48 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0958  histidine kinase  29.81 
 
 		 632 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5361  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 		 265 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 456 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 1385 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1770  histidine kinase  30 
 
 		 778 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 557 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  30.77 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 		 321 aa  47  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 		 321 aa  47  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  27.2 
 
 		 590 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1722  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  34.09 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0271292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1473  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  33.33 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00187817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01455  sensor histidine kinase  32.29 
 
 		 436 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  39.06 
 
 		 779 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 430 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 562 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 632 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 269 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  26.77 
 
 		 310 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 		 905 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 609 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 362 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>