81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0315 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0315  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
147 aa  298  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8976  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  50 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3337  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  48.12 
 
 
158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0177  hypothetical protein  44.7 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.160815  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4415  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  38.41 
 
 
175 aa  100  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00721125  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.1 
 
 
176 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5413  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.01 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3675  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.709341  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0159  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  28.38 
 
 
269 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2285  anti-sigma F factor  32.67 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.17 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
1370 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  28.36 
 
 
250 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2251  anti-sigma F factor  33.33 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5361  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 
265 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
1385 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2974  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3500  anti-sigma regulatory factor  28.07 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314034  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0477  anti-sigma F factor  32.71 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.899963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1558  anti-sigma F factor  30.19 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1662  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.503488  normal  0.167313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
1361 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2553  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 
324 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  27.82 
 
 
162 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 
249 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0373  anti-sigma F factor  33.02 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2284  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 
323 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0993778  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1037  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.62 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  0.807046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2772  anti-sigma F factor  29.13 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  25.62 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  29.27 
 
 
537 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4484  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 
286 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  25.62 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  25.62 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  25.62 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  25.62 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4143  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4095  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69426e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1055  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0411626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4183  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0790038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4206  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000134887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4295  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3830  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3814  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4099  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.56 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256347  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3904  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3984  anti-sigma F factor  27.78 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  26.27 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0253  putative signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00246404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  28.43 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2021  anti-sigma F factor  28.16 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  25.42 
 
 
160 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  25.47 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2515  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538602  normal  0.204677 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  25.62 
 
 
160 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  25.42 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
1390 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2306  anti-sigma F factor  28.16 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
1390 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0862  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.98 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0915  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 
243 aa  42.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.583996 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4123  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  32.81 
 
 
828 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
1390 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  29.46 
 
 
851 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3289  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615968  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  25.42 
 
 
160 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4084  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1393  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.754718 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  35.24 
 
 
148 aa  42  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
139 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  29.91 
 
 
919 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1104  anti-sigma F factor  34.65 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.860331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1681  anti-sigma F factor  27.05 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  28.81 
 
 
1017 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3653  putative anti-sigma regulatory factor serine/threonine protein kinase  26.55 
 
 
149 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>