275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0862 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0862  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
142 aa  289  7e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  59.12 
 
 
148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1225  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  56.39 
 
 
148 aa  156  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00856956  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2021  anti-sigma F factor  52.14 
 
 
140 aa  150  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2306  anti-sigma F factor  52.14 
 
 
140 aa  150  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2065  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  48.94 
 
 
146 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202652  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  51.47 
 
 
148 aa  147  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1104  anti-sigma F factor  52.24 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.860331  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1558  anti-sigma F factor  49.28 
 
 
143 aa  144  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1745  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  54.93 
 
 
153 aa  141  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3441  anti-sigma F factor  47.01 
 
 
145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07010  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  50 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  49.28 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0373  anti-sigma F factor  45.65 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2285  anti-sigma F factor  47.1 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2251  anti-sigma F factor  42.36 
 
 
146 aa  120  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2772  anti-sigma F factor  42.25 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0477  anti-sigma F factor  45 
 
 
157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.899963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3904  anti-sigma F factor  42.96 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4143  anti-sigma F factor  42.96 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3984  anti-sigma F factor  42.96 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3814  anti-sigma F factor  42.96 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3830  anti-sigma F factor  42.96 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4295  anti-sigma F factor  42.96 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4206  anti-sigma F factor  42.96 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000134887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4095  anti-sigma F factor  42.96 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69426e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1055  anti-sigma F factor  42.25 
 
 
146 aa  117  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0411626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4183  anti-sigma F factor  42.25 
 
 
146 aa  117  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0790038  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1662  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.36 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.503488  normal  0.167313 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1681  anti-sigma F factor  45.19 
 
 
154 aa  93.6  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  33.1 
 
 
162 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5777  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.29 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1291  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0030  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.42 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4212  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.53 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.69 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0109  histidine kinase  37.21 
 
 
461 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000786251 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2452  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2684  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.18 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1812  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.48 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0731  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.93 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.993652  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3289  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.19 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615968  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.36 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
781 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4972  ATP-binding region, ATPase-like  33.9 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3135  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.109754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0476  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.54 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  36.17 
 
 
450 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.31 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000275353 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0911  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
290 aa  50.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4414  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
506 aa  50.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5413  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
476 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.92 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3337  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 
321 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.99 
 
 
321 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3439  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1749  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.31 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1473  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  33.04 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00187817  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2146  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2412  histidine kinase  42.86 
 
 
603 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1313  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.83 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  26.28 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  26.28 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2553  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 
324 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
286 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2972  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  26.28 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
762 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111352  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1323  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.9 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105677  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3430  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 
705 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  37.5 
 
 
600 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0334  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.31 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0214018  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2488  putative anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  32 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
422 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13390  Sensory histidine protein kinase  31.25 
 
 
671 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.318892  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  33.05 
 
 
613 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  26.09 
 
 
159 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4099  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
147 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256347  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1428  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 
691 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123829  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  26.09 
 
 
159 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  29.1 
 
 
632 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
962 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1673  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 
139 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.11126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2329  histidine kinase  34.74 
 
 
489 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  31.62 
 
 
638 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8976  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
540 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2332  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.03 
 
 
687 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  28.36 
 
 
632 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  33.67 
 
 
309 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0903  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 
898 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345455  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
1390 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4484  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0096  histidine kinase  27.21 
 
 
525 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
1390 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
399 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>