83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4484 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4484  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
138 aa  265  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.51 
 
 
286 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  26.9 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  27.59 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  26.9 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  26.9 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  26.9 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  26.9 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  26.21 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  26.9 
 
 
160 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  26.21 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  26.21 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  31.03 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1104  anti-sigma F factor  32.14 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.860331  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1745  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1558  anti-sigma F factor  27.27 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0030  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8976  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.96 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  32.77 
 
 
537 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  25.5 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2065  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202652  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4212  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0159  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 
234 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1037  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.17 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  0.807046 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4415  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  30.88 
 
 
175 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00721125  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  22.3 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3002  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 
148 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.258436 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  29.03 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  29.03 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  28.57 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07010  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
143 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5537  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5245  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  38.83 
 
 
919 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5156  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0477  anti-sigma F factor  29.17 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.899963  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0862  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0315  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3337  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
362 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4143  anti-sigma F factor  25 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3984  anti-sigma F factor  25 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3814  anti-sigma F factor  25 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3830  anti-sigma F factor  25 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4295  anti-sigma F factor  25 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4095  anti-sigma F factor  25 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69426e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1055  anti-sigma F factor  25 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0411626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4183  anti-sigma F factor  25 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0790038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2306  anti-sigma F factor  29.41 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4206  anti-sigma F factor  25 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000134887  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2021  anti-sigma F factor  29.41 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2772  anti-sigma F factor  25 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3904  anti-sigma F factor  25 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
362 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  41.94 
 
 
249 aa  43.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
363 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
1361 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.1 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  45.59 
 
 
713 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2165  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
358 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3706  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.8 
 
 
133 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0345536  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0911  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.95 
 
 
290 aa  41.2  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2285  anti-sigma F factor  22.69 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
360 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
354 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3283  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.373959  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
807 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  30.39 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
361 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3289  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615968  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  31.67 
 
 
568 aa  40.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
492 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1087  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  22.81 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
762 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111352  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2390  histidine kinase  39.58 
 
 
757 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.534498  normal  0.927047 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2743  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158156  normal  0.043677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2113  ATPase domain-containing protein  39.58 
 
 
757 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275639  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2713  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 
158 aa  40  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.465561  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2757  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 
158 aa  40  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1010  signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 
626 aa  40  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 
561 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>