220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1681 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1681  anti-sigma F factor  100 
 
 
154 aa  308  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1558  anti-sigma F factor  65.94 
 
 
143 aa  174  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  59.29 
 
 
149 aa  170  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0373  anti-sigma F factor  60.43 
 
 
146 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2285  anti-sigma F factor  58.52 
 
 
141 aa  164  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1745  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  57.04 
 
 
153 aa  163  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2251  anti-sigma F factor  58.99 
 
 
146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1662  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  55.3 
 
 
146 aa  158  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.503488  normal  0.167313 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2021  anti-sigma F factor  59.56 
 
 
140 aa  153  9e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2306  anti-sigma F factor  59.56 
 
 
140 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4183  anti-sigma F factor  53.24 
 
 
146 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0790038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1055  anti-sigma F factor  53.24 
 
 
146 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0411626 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4095  anti-sigma F factor  52.52 
 
 
146 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69426e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4143  anti-sigma F factor  52.52 
 
 
146 aa  149  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3984  anti-sigma F factor  52.52 
 
 
146 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3814  anti-sigma F factor  52.52 
 
 
146 aa  149  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3830  anti-sigma F factor  52.52 
 
 
146 aa  149  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386677  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4206  anti-sigma F factor  52.52 
 
 
146 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000134887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4295  anti-sigma F factor  52.52 
 
 
146 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3904  anti-sigma F factor  52.52 
 
 
146 aa  149  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2772  anti-sigma F factor  52.52 
 
 
146 aa  149  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0477  anti-sigma F factor  53.73 
 
 
157 aa  140  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.899963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  51.77 
 
 
148 aa  130  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  46.43 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2065  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  52.71 
 
 
146 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202652  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0862  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.86 
 
 
142 aa  117  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1104  anti-sigma F factor  47.06 
 
 
148 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.860331  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07010  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  48.91 
 
 
143 aa  111  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3441  anti-sigma F factor  44.53 
 
 
145 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1225  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.08 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00856956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  32.41 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  32.41 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  32.41 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  32.41 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  32.41 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  32.41 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  31.72 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  31.03 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  31.72 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  31.03 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  32.65 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0334  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.16 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0911  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.72 
 
 
290 aa  60.8  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
321 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
321 aa  60.5  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  28.97 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  28.97 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  27.59 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0179  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.05 
 
 
142 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  39.42 
 
 
309 aa  57.8  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0867  ATPase domain-containing protein  35.79 
 
 
632 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1812  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.8 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  32.77 
 
 
313 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0658  sensor histide kinase  33.61 
 
 
315 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0628  signal transduction protein  39.42 
 
 
307 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  34.38 
 
 
1187 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1291  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.89 
 
 
139 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2838  putative anti-sigma regulatory factor serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4100  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
154 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39959  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0731  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.993652  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
632 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3697  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
405 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
632 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  31.31 
 
 
305 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4099  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256347  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0958  histidine kinase  32.63 
 
 
632 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0691  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.71 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1473  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  35.24 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00187817  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
372 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0932  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
632 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1393  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.754718 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3799  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000337486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  33.04 
 
 
310 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4972  ATP-binding region, ATPase-like  29.66 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3290  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.018648  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1533  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
403 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 
688 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 
762 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.18 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000275353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.74 
 
 
286 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4969  putative two-component sensor  28 
 
 
698 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3787  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
560 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57170  putative two-component sensor  28 
 
 
698 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0092  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.48 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.305697  hitchhiker  0.00140915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0663  putative anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  22.39 
 
 
142 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00575622  normal  0.0631773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4818  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 
140 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
588 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
372 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5024  histidine kinase  33.33 
 
 
457 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
553 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3168  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.482123  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0315  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
781 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  31.82 
 
 
524 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  30.46 
 
 
250 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2297  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5588  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
773 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.74 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 
571 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>