More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2542 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 155 aa  306  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  56 
 
 		 153 aa  170  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  47.33 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  49.33 
 
 		 173 aa  147  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  46.9 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  50.96 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  48.59 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  45.14 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  43.15 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  43.75 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 180 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 180 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  42.36 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 171 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  40.28 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 179 aa  104  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 168 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 158 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  31.47 
 
 		 175 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  31.47 
 
 		 175 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  31.47 
 
 		 175 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  31.47 
 
 		 175 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  31.47 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  31.47 
 
 		 229 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 202 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 202 aa  84.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 		 175 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  30.07 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2077  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.772794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  32.26 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  28.47 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  31.61 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  31.72 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  31.61 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  30.46 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  28.47 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  30.32 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>