More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1741 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
252 aa  483  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  40.16 
 
 
251 aa  148  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
251 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 
246 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  38.71 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  39.27 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
249 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 
246 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 
254 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 
246 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
256 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
256 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
256 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  42.51 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  34.82 
 
 
245 aa  109  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
247 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  32.39 
 
 
246 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
254 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 
260 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
252 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 
245 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 
250 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  31.72 
 
 
260 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  28.29 
 
 
243 aa  99  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  30.2 
 
 
245 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.32 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.9 
 
 
245 aa  95.1  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 
248 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  31.43 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  39.52 
 
 
245 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 
243 aa  92  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
254 aa  88.6  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
248 aa  85.5  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  27.89 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  26.29 
 
 
240 aa  82  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.88 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  32.17 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  29.72 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1382  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.91 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.99 
 
 
255 aa  72  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  25.81 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.91 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.75 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.23 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.57 
 
 
238 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.48 
 
 
247 aa  62  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  30.58 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  28.28 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05547  conserved hypothetical protein  26.48 
 
 
283 aa  60.1  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  26.21 
 
 
240 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
249 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
238 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1759  hypothetical protein  26.21 
 
 
240 aa  58.9  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.11 
 
 
264 aa  58.9  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.89 
 
 
257 aa  58.5  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 
238 aa  58.5  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136725 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.68 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  27.46 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1209  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  23.64 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2184  hypothetical protein  27.18 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.78 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.187579 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.39 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2345  short chain dehydrogenase  27.54 
 
 
297 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190376  hitchhiker  0.00770319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.3 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.88847  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  28.51 
 
 
281 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.83 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.46 
 
 
222 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.38 
 
 
248 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.29 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563434  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  28.44 
 
 
279 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.42 
 
 
245 aa  55.5  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00978147  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  29.24 
 
 
278 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.73 
 
 
290 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2157  hypothetical protein  26.21 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1569  short chain dehydrogenase  33.58 
 
 
280 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241614  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.25 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.05 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.27 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300792  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.12 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  hitchhiker  0.000208801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>