50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0019 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0019  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0401744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0415  transcriptional regulator, XRE family  86.21 
 
 		 144 aa  248  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0587851  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0020  transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.118071  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 256 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0888  hypothetical protein  38.27 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000369375  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 198 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 219 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 219 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 219 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 252 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 255 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 505 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 292 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  39.66 
 
 		 200 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 255 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1673  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189543  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  40.26 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  40.26 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4440  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1308  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019995  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1266  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461097  normal  0.0226828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4003  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000134059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  40.91 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1317  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000865545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1295  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1716  Cro/CI family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000130124  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 194 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 219 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8538  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 321 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000674281  hitchhiker  0.0000867328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5514  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 222 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  27.87 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 292 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21850  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000342125  hitchhiker  0.00251437 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 101 aa  40.4  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1596  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.32 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000735944  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  32.31 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4515  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  29.1 
 
 		 360 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0750  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  32.31 
 
 		 72 aa  40  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2239  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  38.98 
 
 		 368 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 191 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>