54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0415 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0415  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 144 aa  296  8e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0587851  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0019  transcriptional regulator, XRE family  86.21 
 
 		 144 aa  248  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0401744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 256 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0020  transcriptional regulator, XRE family  48 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.118071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4440  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 252 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0888  hypothetical protein  39.08 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000369375  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5158  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 505 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 255 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 200 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 292 aa  43.5  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5514  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 222 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4848  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 496 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 130 aa  42  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3771  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.471902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 182 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 191 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 191 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 191 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 190 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 292 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4806  putative DNA-binding transcriptional regulator  47.17 
 
 		 203 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3063  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 201 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  38.33 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0750  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.33 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 211 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 211 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3617  XRE family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1295  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 222 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 225 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 191 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 300 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>