185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0069 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  100 
 
 
362 aa  747    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  38.48 
 
 
353 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  27.61 
 
 
298 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
308 aa  102  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  29.28 
 
 
319 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  28.52 
 
 
264 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 
302 aa  99.8  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 
319 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  30.38 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
318 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
318 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  27 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
318 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
318 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
318 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
318 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  30 
 
 
318 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  30.92 
 
 
321 aa  95.5  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  27.39 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 
299 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  30.4 
 
 
319 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  30.4 
 
 
319 aa  93.2  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  24.54 
 
 
318 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  27.76 
 
 
331 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  25.4 
 
 
316 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  30.62 
 
 
335 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  30.62 
 
 
335 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  26.05 
 
 
316 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  23.44 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  28.51 
 
 
319 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 
319 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  24.18 
 
 
317 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  29.2 
 
 
339 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.18 
 
 
319 aa  89.7  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  24.18 
 
 
316 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  24.18 
 
 
316 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 
319 aa  89.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  24.18 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  25.83 
 
 
319 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  27.71 
 
 
319 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 
295 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 
326 aa  87.4  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 
319 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 
319 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  26.91 
 
 
319 aa  86.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  24.5 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  27.4 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  25.55 
 
 
320 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  27.73 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  25.81 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  26.18 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  27.47 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  27.37 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  27.76 
 
 
637 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1764  Na-translocating NADH-quinone reductase subunit A  23.81 
 
 
329 aa  77  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439297  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  24.09 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  25.44 
 
 
275 aa  77  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  28 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  25.16 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  25.4 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1653  beta-lactamase domain-containing protein  24.71 
 
 
238 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139658  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 
319 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
271 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  24.64 
 
 
304 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  24.38 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  25.32 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  23.8 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  23.21 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  21.68 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  24.85 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  25.74 
 
 
644 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  23.08 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  26.39 
 
 
271 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  27.39 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  25.95 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  27.41 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  25.38 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
321 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  26.17 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2169  Zn-dependent hydrolase  22.01 
 
 
288 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0145337  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  24.45 
 
 
312 aa  63.5  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2414  metallo-beta-lactamase family protein  22.01 
 
 
288 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 
319 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  24.48 
 
 
314 aa  63.5  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 
249 aa  63.2  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  23.18 
 
 
441 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>