232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3027 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3027  pH-dependent sodium/proton antiporter  100 
 
 
449 aa  870    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.751517 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0107  pH-dependent sodium/proton antiporter  84.08 
 
 
461 aa  678    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2207  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.53 
 
 
441 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2196  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.53 
 
 
450 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.045378  normal  0.0524961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2253  pH-dependent sodium/proton antiporter  62.31 
 
 
450 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0345  Na+/H+ antiporter NhaA  60.97 
 
 
434 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2105  Na+/H+ antiporter NhaA  63.59 
 
 
462 aa  492  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2476  pH-dependent sodium/proton antiporter  61.7 
 
 
464 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.946252  normal  0.639371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4630  Na+/H+ antiporter NhaA  63.7 
 
 
461 aa  484  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3924  pH-dependent sodium/proton antiporter  59.87 
 
 
447 aa  482  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00452006  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2583  pH-dependent sodium/proton antiporter  63.53 
 
 
442 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.281476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0203  Na+/H+ antiporter NhaA  58.9 
 
 
434 aa  458  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0229594  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0405  Na+/H+ antiporter NhaA  61.52 
 
 
437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12160  Na+/H+ antiporter NhaA  59 
 
 
436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2920  Na+/H+ antiporter NhaA  63.37 
 
 
463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2262  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.28 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50629  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1152  Na+/H+ antiporter NhaA  57.62 
 
 
453 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6928  Na+/H+ antiporter NhaA  54.39 
 
 
446 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126973  normal  0.148656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2118  pH-dependent sodium/proton antiporter  56.7 
 
 
436 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0195602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3507  Na+/H+ antiporter NhaA  57.94 
 
 
429 aa  431  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.486632  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1657  Na+/H+ antiporter NhaA  61.89 
 
 
432 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2512  Na+/H+ antiporter NhaA  57.77 
 
 
451 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116131  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2573  Na+/H+ antiporter NhaA  58.28 
 
 
539 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4510  Na+/H+ antiporter NhaA  51.33 
 
 
422 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2301  Na+/H+ antiporter NhaA  51.6 
 
 
414 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30430  Na+/H+ antiporter NhaA  57.89 
 
 
440 aa  352  1e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27000  Na+/H+ antiporter NhaA  47.42 
 
 
429 aa  329  7e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.358876  normal  0.743342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0066  Na+/H+ antiporter NhaA  46.77 
 
 
433 aa  321  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0476  Na+/H+ antiporter NhaA  48.18 
 
 
408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1238  Na+/H+ antiporter NhaA  54.55 
 
 
431 aa  307  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1410  Na+/H+ antiporter NhaA  48.29 
 
 
442 aa  295  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  44.55 
 
 
402 aa  286  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0880  Na+/H+ antiporter NhaA  44.72 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0261  Na+/H+ antiporter NhaA  44.97 
 
 
390 aa  280  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4842  Na+/H+ antiporter NhaA  44.67 
 
 
413 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0925  Na+/H+ antiporter NhaA  47.58 
 
 
436 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.39 
 
 
397 aa  264  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.12 
 
 
391 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.4 
 
 
399 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  41.91 
 
 
401 aa  259  9e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  41.67 
 
 
382 aa  259  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0028  Na+/H+ antiporter NhaA  39.36 
 
 
396 aa  256  5e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  43.18 
 
 
404 aa  255  9e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  38.52 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.56 
 
 
394 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3091  Na+/H+ antiporter NhaA  48.76 
 
 
447 aa  252  8.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.904983  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0693  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.47 
 
 
396 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  42.07 
 
 
406 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  39.03 
 
 
425 aa  250  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.25 
 
 
409 aa  249  9e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.82 
 
 
382 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  42.22 
 
 
391 aa  247  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.78 
 
 
399 aa  246  8e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  39.8 
 
 
383 aa  246  8e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.31 
 
 
382 aa  246  8e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0515  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.52 
 
 
393 aa  246  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.46 
 
 
391 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.89 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.41 
 
 
389 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.41 
 
 
389 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.41 
 
 
389 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.41 
 
 
389 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.27 
 
 
391 aa  243  7e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  42.93 
 
 
399 aa  242  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0364  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.9 
 
 
391 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  38.68 
 
 
455 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.98 
 
 
389 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.49 
 
 
389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.93 
 
 
391 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.06 
 
 
400 aa  240  4e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  40.26 
 
 
393 aa  240  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  36.55 
 
 
382 aa  239  9e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  40.15 
 
 
396 aa  239  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.5 
 
 
390 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  39.59 
 
 
424 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  36.55 
 
 
382 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  42.41 
 
 
392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.48 
 
 
392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.96 
 
 
400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  40.48 
 
 
408 aa  236  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.46 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.21 
 
 
389 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0406  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.43 
 
 
420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.25 
 
 
395 aa  234  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  36.55 
 
 
382 aa  234  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.43 
 
 
397 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0397  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.43 
 
 
393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5174  sodium-proton antiporter NhaA  41.55 
 
 
391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.35 
 
 
397 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.71 
 
 
407 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  41.82 
 
 
423 aa  232  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  37.31 
 
 
386 aa  231  3e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  39.95 
 
 
408 aa  230  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  37.26 
 
 
455 aa  229  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  36.62 
 
 
391 aa  229  8e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.4 
 
 
398 aa  229  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  38.05 
 
 
470 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  35.73 
 
 
444 aa  228  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.82 
 
 
394 aa  226  7e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  36.77 
 
 
450 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>