More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2924 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 265 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  55.21 
 
 		 250 aa  268  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  47.62 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.39 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  46.77 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  45.42 
 
 		 233 aa  211  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  45.63 
 
 		 250 aa  211  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.63 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.56 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  45.1 
 
 		 251 aa  208  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  45.14 
 
 		 248 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 232 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  43.32 
 
 		 244 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  43.32 
 
 		 244 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 265 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 265 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  44.76 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  41.77 
 
 		 231 aa  198  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1773  two component transcriptional regulator  45.17 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178114  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0854  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.7 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.57 
 
 		 243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2652  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.85 
 
 		 264 aa  195  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2937  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.511337  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  42.58 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 263 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.46 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2828  response regulator receiver  42.06 
 
 		 231 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  40.15 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  42.52 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.34 
 
 		 239 aa  181  9.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01450  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.71 
 
 		 320 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.610434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2906  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.78 
 
 		 277 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  41.11 
 
 		 228 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.87 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  41.06 
 
 		 230 aa  175  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.44 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 235 aa  171  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  36.25 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3656  two component transcriptional regulator  41.57 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 229 aa  168  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.28 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1085  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.08 
 
 		 235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  37.01 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  42.17 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  38.28 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.33 
 
 		 242 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.28 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.9 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  37.15 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.8 
 
 		 234 aa  162  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 234 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4990  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 228 aa  162  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  36.18 
 
 		 241 aa  161  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  38.58 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  38.31 
 
 		 225 aa  161  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.66 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 		 219 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 		 219 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  36.18 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0657  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.2 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.118815  hitchhiker  0.000311431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.15 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1781  response regulator receiver protein  43.84 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  39.44 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  40.48 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.2 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  38.37 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1549  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 241 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 230 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  37.65 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.45 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.82 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.31 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  34.13 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3962  two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  36.15 
 
 		 236 aa  159  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  35.46 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 239 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 246 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  38.31 
 
 		 229 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  33.98 
 
 		 237 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 242 aa  159  6e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  36.51 
 
 		 222 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  38.62 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  35.66 
 
 		 239 aa  158  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>