275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0890 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  100 
 
 
357 aa  726    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  60.4 
 
 
376 aa  418  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  32.46 
 
 
383 aa  153  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  29.94 
 
 
424 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  29.45 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  31.67 
 
 
388 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  33.21 
 
 
381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  27.33 
 
 
402 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  27.38 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  30.65 
 
 
385 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  29.08 
 
 
390 aa  119  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4575  hypothetical protein  31.75 
 
 
326 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.116237 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  30.06 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  27.74 
 
 
474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  29.31 
 
 
400 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  29.31 
 
 
400 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  27.44 
 
 
463 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  32.51 
 
 
448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  29.45 
 
 
390 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  29.15 
 
 
420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  28.44 
 
 
387 aa  109  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  30.57 
 
 
259 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  27.51 
 
 
385 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  27.58 
 
 
403 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  26.27 
 
 
386 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  27.03 
 
 
386 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  30.51 
 
 
434 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  28.07 
 
 
417 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  26.13 
 
 
386 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  29.36 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  29.71 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  28.4 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  31.58 
 
 
401 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  35.26 
 
 
423 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  26.05 
 
 
420 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  25.69 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  24.93 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  26.52 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0266  fermentation/respiration switch protein  29.67 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00234  fermentation/respiration switch protein  29.67 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0293  fermentation/respiration switch protein  29.67 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0072363 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00237  hypothetical protein  29.67 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3342  fermentation/respiration switch protein  29.67 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3368  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  29.33 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0271  fermentation/respiration switch protein  29.33 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0236  fermentation/respiration switch protein  29.33 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  28.8 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0284  fermentation/respiration switch protein  29.67 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0765  fermentation/respiration switch protein  29.24 
 
 
414 aa  75.9  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3940  hypothetical protein  23.48 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000344769  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  31.1 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  24.66 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  25.12 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.31 
 
 
406 aa  72  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  25.12 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004270  hypothetical protein  30.53 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291288  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1866  fermentation/respiration switch protein  27.37 
 
 
415 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000738572  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.57 
 
 
695 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01160  fermentation/respiration switch protein  29.01 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0976  fermentation/respiration switch protein  25.96 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3303  fermentation/respiration switch protein  30.26 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000661178  hitchhiker  0.000575901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3152  fermentation/respiration switch protein  30.26 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3290  fermentation/respiration switch protein  30.26 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0352  fermentation/respiration switch protein  25.41 
 
 
414 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0348  fermentation/respiration switch protein  25.41 
 
 
414 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0367  fermentation/respiration switch protein  25.41 
 
 
414 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0359  fermentation/respiration switch protein  25.16 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000175577 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0357  fermentation/respiration switch protein  25.16 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1006  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.62 
 
 
438 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  29.45 
 
 
634 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  26.85 
 
 
321 aa  63.5  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.45 
 
 
733 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  22.19 
 
 
374 aa  63.5  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0965  fermentation/respiration switch protein  29.69 
 
 
415 aa  63.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  25.17 
 
 
292 aa  62.8  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  21.78 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  26.22 
 
 
418 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2193  hypothetical protein  30.5 
 
 
674 aa  60.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  26.49 
 
 
467 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.94 
 
 
656 aa  60.1  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  20.82 
 
 
255 aa  59.7  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  23.86 
 
 
442 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  28.25 
 
 
406 aa  59.7  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6547  alpha/beta hydrolase BEM46  28.57 
 
 
268 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  32.12 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  31.79 
 
 
580 aa  57.4  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  31.75 
 
 
317 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1554  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
359 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  24.66 
 
 
373 aa  56.2  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.7 
 
 
688 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  20.29 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  24.28 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3567  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.43 
 
 
695 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  32.09 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2627  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.76 
 
 
668 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.76 
 
 
645 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  31.69 
 
 
256 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  31.09 
 
 
318 aa  53.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.83 
 
 
633 aa  53.9  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0898  fermentation/respiration switch protein  26.56 
 
 
416 aa  53.5  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>