118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6547 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6547  alpha/beta hydrolase BEM46  100 
 
 
268 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  37.39 
 
 
268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3465  hypothetical protein  35.27 
 
 
293 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0852  hypothetical protein  30 
 
 
247 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3326  hypothetical protein  35 
 
 
245 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.884762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0920  hypothetical protein  34.81 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.81019e-33 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  28.15 
 
 
282 aa  95.9  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  31.18 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  27.89 
 
 
282 aa  86.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  28.97 
 
 
287 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  27.07 
 
 
267 aa  78.6  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  29.91 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  25.74 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  31.84 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0482  hydrolase of the alpha/beta superfamily  30.48 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0662813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  26.05 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  28.88 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  28.95 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  28.27 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  29.71 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2272  hypothetical protein  25.3 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  26.63 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  29.63 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4295  hypothetical protein  29.44 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0269643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  25.77 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  27.97 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  26.84 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  27.52 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  32.98 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3674  hypothetical protein  27.59 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0158425  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3977  hypothetical protein  25.7 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  24.15 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  25.54 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3993  hypothetical protein  30.3 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0129209  normal  0.0990612 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  28.88 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.14 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  28.11 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2105  hypothetical protein  26.94 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290661  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  25.15 
 
 
271 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0358  hypothetical protein  28.19 
 
 
270 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233875  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  30.22 
 
 
376 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  26.74 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  25.32 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  24.9 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  26.09 
 
 
307 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.57 
 
 
357 aa  59.3  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  22.81 
 
 
284 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  32.47 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  22.8 
 
 
290 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  32.47 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  32.47 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  26.11 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  27.32 
 
 
292 aa  56.6  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  21.94 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  25.94 
 
 
314 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3153  hypothetical protein  25.51 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.913787  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  25.11 
 
 
309 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  27.08 
 
 
297 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  29.26 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  22.43 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  24.41 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  24.51 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  22.14 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  22.52 
 
 
284 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  22.52 
 
 
284 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  22.52 
 
 
284 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  22.52 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  22.52 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  20.77 
 
 
267 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  22.05 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  24.41 
 
 
296 aa  52  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7576  predicted protein  26.38 
 
 
162 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.30482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  24.07 
 
 
298 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2845  temperature sensitive supressor-like  23.16 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  23.83 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  25.16 
 
 
277 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  24.88 
 
 
311 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3599  hypothetical protein  26.74 
 
 
281 aa  50.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40120  predicted protein  24.58 
 
 
304 aa  50.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98867  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  24.24 
 
 
304 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  27.65 
 
 
294 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  23.71 
 
 
314 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  25.77 
 
 
267 aa  49.3  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  27.65 
 
 
294 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  27.68 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1061  temperature sensitive supressor-like protein  24.32 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.133168  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  28.92 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  24.35 
 
 
303 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 
289 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  22.69 
 
 
298 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2084  alpha/beta fold family hydrolase N  21.54 
 
 
261 aa  46.2  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.29 
 
 
297 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  20.94 
 
 
281 aa  45.8  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4186  putative alpha/beta superfamily hydrolase  23.86 
 
 
289 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0367374  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
289 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  24.7 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  25.15 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1512  lysophospholipase-like protein  28.89 
 
 
481 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145364  normal  0.79718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0161  thioesterase  33.08 
 
 
436 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>