89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3326 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3326  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.884762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0920  hypothetical protein  91.84 
 
 		 245 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.81019e-33 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0852  hypothetical protein  54.1 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  34.43 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6547  alpha/beta hydrolase BEM46  35 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  37.82 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2272  hypothetical protein  29.43 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  30.08 
 
 		 275 aa  89.4  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 285 aa  89  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  32.53 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  30.95 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  32.79 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  30.19 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  32.76 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  31.73 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  29.23 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  32.04 
 
 		 282 aa  72  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4295  hypothetical protein  35.09 
 
 		 289 aa  72  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0269643  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  32.1 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  28.08 
 
 		 265 aa  72  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  34.09 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0482  hydrolase of the alpha/beta superfamily  34.46 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0662813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  28.74 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2105  hypothetical protein  29.82 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290661  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0358  hypothetical protein  32.04 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  29.22 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  30.68 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  26.14 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  34.66 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  32.69 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  31.98 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  24.24 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  30.59 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  27.94 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3977  hypothetical protein  28.48 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_6846  predicted protein  29.3 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  29.06 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  28.77 
 
 		 324 aa  62  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  30.89 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  30.89 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  30.89 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  28.95 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  29.78 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  24.32 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3674  hypothetical protein  23.53 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0158425  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  25.29 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4186  putative alpha/beta superfamily hydrolase  34.53 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0367374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  32.24 
 
 		 285 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3993  hypothetical protein  26.21 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0129209  normal  0.0990612 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7576  predicted protein  25.32 
 
 		 162 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.30482 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  28.48 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  24.68 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  24.34 
 
 		 290 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  27.34 
 
 		 289 aa  52.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  27.08 
 
 		 306 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  29.17 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  27.8 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  28.16 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  28.21 
 
 		 293 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1334  hydrolase with alpha/beta fold  23.58 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.706412  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  29.66 
 
 		 294 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  29.93 
 
 		 294 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  25.25 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3184  hypothetical protein  31.07 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 		 421 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  24.83 
 
 		 294 aa  45.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  27.46 
 
 		 297 aa  45.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.52 
 
 		 294 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1061  temperature sensitive supressor-like protein  28.96 
 
 		 276 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.133168  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2845  temperature sensitive supressor-like  26.13 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3869  hypothetical protein  25.13 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02210  conserved hypothetical protein  24.46 
 
 		 358 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  28.19 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  27.27 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  29.07 
 
 		 331 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.04 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2250  hypothetical protein  27.14 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0744854  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  27.71 
 
 		 294 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5113  predicted protein  33.91 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00868611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  27.27 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  26.17 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  26.73 
 
 		 303 aa  42.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  35.16 
 
 		 298 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  35.16 
 
 		 286 aa  42  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.917289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>