148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2205 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  528  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2272  hypothetical protein  36.08 
 
 
259 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2105  hypothetical protein  37.06 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290661  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  30.96 
 
 
270 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0482  hydrolase of the alpha/beta superfamily  32.49 
 
 
272 aa  113  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0662813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  30.86 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  29.49 
 
 
267 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  30.64 
 
 
276 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  30.36 
 
 
282 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
285 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3993  hypothetical protein  31.84 
 
 
296 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0129209  normal  0.0990612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  30.89 
 
 
266 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3977  hypothetical protein  34.48 
 
 
278 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  26.94 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.63 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3674  hypothetical protein  29.69 
 
 
296 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0158425  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  24.06 
 
 
275 aa  93.2  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  25.81 
 
 
282 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  29.08 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  25.86 
 
 
282 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0358  hypothetical protein  29.91 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  30.05 
 
 
297 aa  85.5  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  30.95 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  28.81 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6547  alpha/beta hydrolase BEM46  29.91 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  26.74 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  27.15 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  24.26 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  34.13 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2250  hypothetical protein  31.37 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0744854  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  25.78 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  29.23 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  26.64 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  28.45 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  26.74 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  26.2 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  25.96 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  25.59 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  28.43 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  26.19 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  29.17 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0852  hypothetical protein  28.12 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  30.34 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  27.9 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  27.83 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  30.05 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  25 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  26.55 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  24.64 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3184  hypothetical protein  29.89 
 
 
300 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  28.43 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3465  hypothetical protein  29.47 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  25 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3599  hypothetical protein  27 
 
 
281 aa  67  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  33.15 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  25 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40120  predicted protein  25.71 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98867  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  26.77 
 
 
314 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  23.74 
 
 
285 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  24.64 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1334  hydrolase with alpha/beta fold  25 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.706412  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  30.68 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  26.5 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  25.21 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  27.4 
 
 
296 aa  63.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  25 
 
 
278 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  28.08 
 
 
279 aa  62.4  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3326  hypothetical protein  28.95 
 
 
245 aa  62  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.884762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  27.91 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  31.52 
 
 
336 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0920  hypothetical protein  29.41 
 
 
245 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.81019e-33 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  25.36 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  26.41 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  25.52 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  27.11 
 
 
286 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  26.94 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  26.84 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21275  predicted protein  26.06 
 
 
239 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0629377  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4295  hypothetical protein  29.7 
 
 
289 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0269643  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  25.74 
 
 
295 aa  55.8  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02210  conserved hypothetical protein  26.59 
 
 
358 aa  55.5  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7576  predicted protein  30.54 
 
 
162 aa  55.5  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.30482 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5113  predicted protein  26.04 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00868611  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  26.01 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4186  putative alpha/beta superfamily hydrolase  28.05 
 
 
289 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0367374  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  24.16 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28215  predicted protein  24.15 
 
 
297 aa  52.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  24.15 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3869  hypothetical protein  26.39 
 
 
287 aa  52.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  24.15 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  24.15 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  29.21 
 
 
299 aa  52.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  25 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  24.61 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0869  alpha/beta fold family hydrolase  34.96 
 
 
308 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  25 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  27.17 
 
 
292 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  24.62 
 
 
284 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  25 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>