86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3993 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3993  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0129209  normal  0.0990612 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3674  hypothetical protein  81.76 
 
 		 296 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0158425  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3977  hypothetical protein  56.63 
 
 		 278 aa  289  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  31.84 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0482  hydrolase of the alpha/beta superfamily  35.03 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0662813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2105  hypothetical protein  35.96 
 
 		 256 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290661  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  34.97 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2272  hypothetical protein  30.65 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  30.56 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  27.17 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0358  hypothetical protein  29.58 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233875  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  28.49 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  31.15 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  30.65 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  30.92 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  30.17 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  32.76 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  27.23 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  33.78 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  27.7 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  30.57 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  27.6 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3465  hypothetical protein  31.97 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  30.06 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  29.23 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  29.41 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  29.65 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0852  hypothetical protein  22.94 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  25.93 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6547  alpha/beta hydrolase BEM46  30.3 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  27 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  26.58 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  30.37 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0920  hypothetical protein  27.59 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.81019e-33 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  28.57 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  28.21 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  28.02 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.26 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3599  hypothetical protein  28.14 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  26.82 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  26.91 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3326  hypothetical protein  26.21 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.884762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  27.93 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  29.67 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3869  hypothetical protein  28.5 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  31.82 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  27.81 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  22.92 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  25.45 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  25.25 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  25.25 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  28.98 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  27.5 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1334  hydrolase with alpha/beta fold  24.56 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.706412  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2250  hypothetical protein  33.07 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0744854  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  26.82 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  24.58 
 
 		 332 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  31.33 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  30.23 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  25.49 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  27.44 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  26.18 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  23.84 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  27.32 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  29.45 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3184  hypothetical protein  27.88 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1061  temperature sensitive supressor-like protein  27.27 
 
 		 276 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.133168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  32.45 
 
 		 275 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  32.45 
 
 		 275 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  32.45 
 
 		 275 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  31.25 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  28.82 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  25.5 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  28.44 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.23 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  27.22 
 
 		 299 aa  45.8  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  28.04 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40120  predicted protein  27.87 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98867  normal  0.767485 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  26.92 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  29.76 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  21.05 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5113  predicted protein  28.81 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00868611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  33.72 
 
 		 267 aa  43.5  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  26.44 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03833  conserved hypothetical protein  39.06 
 
 		 417 aa  42.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.028827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>