81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0852 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0852  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  510  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0920  hypothetical protein  57.4 
 
 
245 aa  266  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.81019e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3326  hypothetical protein  57.14 
 
 
245 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.884762  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  31.84 
 
 
268 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6547  alpha/beta hydrolase BEM46  30 
 
 
268 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  30.5 
 
 
275 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  30.95 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3465  hypothetical protein  29.53 
 
 
293 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  29.6 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  29.91 
 
 
265 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  30.22 
 
 
267 aa  85.1  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  29.46 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  29.39 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2272  hypothetical protein  26.98 
 
 
259 aa  82  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  29.62 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  23.16 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  33.52 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  26.98 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  23.6 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  30.34 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2105  hypothetical protein  30.49 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290661  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  25 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3977  hypothetical protein  27.03 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  30 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  28.91 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  30.48 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  28.12 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  30.69 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1334  hydrolase with alpha/beta fold  25.94 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.706412  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_6846  predicted protein  31.25 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.175965  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0482  hydrolase of the alpha/beta superfamily  31.76 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0662813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  26.98 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  28.38 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  29.8 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  29.8 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  29.8 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  26.98 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  27.19 
 
 
307 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3993  hypothetical protein  22.94 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0129209  normal  0.0990612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.61 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  30.39 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  26.54 
 
 
289 aa  63.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0358  hypothetical protein  27.86 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233875  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7576  predicted protein  28.57 
 
 
162 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.30482 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  26.94 
 
 
278 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  27.56 
 
 
295 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3674  hypothetical protein  22.51 
 
 
296 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0158425  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  26.49 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  23.72 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  29.96 
 
 
279 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  32.24 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  23.47 
 
 
290 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.41 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  27.23 
 
 
306 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  29.32 
 
 
297 aa  52.4  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  29.05 
 
 
276 aa  52.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  28 
 
 
336 aa  52  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  28.72 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  27.48 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4295  hypothetical protein  29.19 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0269643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2250  hypothetical protein  26.87 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0744854  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3184  hypothetical protein  29.96 
 
 
300 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  28.49 
 
 
281 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  30 
 
 
299 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  27.63 
 
 
285 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1061  temperature sensitive supressor-like protein  26.79 
 
 
276 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.133168  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1048  alpha/beta hydrolase fold protein  23.04 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  24.86 
 
 
292 aa  46.2  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  28.14 
 
 
295 aa  45.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  25.59 
 
 
293 aa  45.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  27.92 
 
 
285 aa  45.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2923  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  41.67 
 
 
287 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  27.03 
 
 
301 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4323  Thioesterase  30.38 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  22.61 
 
 
324 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  28.57 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  26.04 
 
 
298 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  23.37 
 
 
298 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  25.95 
 
 
301 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4186  putative alpha/beta superfamily hydrolase  27.94 
 
 
289 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0367374  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>