133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2105 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2105  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290661  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2272  hypothetical protein  40.15 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  37.06 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0482  hydrolase of the alpha/beta superfamily  37.5 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0662813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  27.97 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  28.25 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  34.67 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  31.33 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  33.99 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3993  hypothetical protein  35.96 
 
 		 296 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0129209  normal  0.0990612 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3977  hypothetical protein  32.51 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  31.62 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3465  hypothetical protein  32.17 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  26.74 
 
 		 276 aa  99.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3674  hypothetical protein  34.78 
 
 		 296 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0158425  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  29.25 
 
 		 282 aa  93.2  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 285 aa  92.8  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  32.16 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  27.01 
 
 		 282 aa  88.6  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  27.71 
 
 		 271 aa  88.6  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  35.39 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0852  hypothetical protein  30.49 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  30.35 
 
 		 287 aa  85.9  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  32.75 
 
 		 281 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  28.51 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  23.38 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  28.51 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  26.2 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  30.66 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  29.61 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0358  hypothetical protein  31.78 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233875  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3326  hypothetical protein  30.29 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.884762  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  28.19 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  24.73 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  27.75 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.51 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  26.41 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  26.16 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  24.91 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  30.8 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  28.68 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  26.87 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  26.89 
 
 		 295 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0920  hypothetical protein  30.41 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.81019e-33 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  28.77 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  26.37 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  25.81 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  30.48 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  30.48 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  30.48 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  30.32 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  28.38 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  27.45 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  30.61 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  30.65 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6547  alpha/beta hydrolase BEM46  26.94 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40120  predicted protein  24.57 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98867  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  30.61 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  26.12 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  26.12 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  26.12 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  26.12 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  28.37 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  25.1 
 
 		 289 aa  62  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  23.27 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  28.37 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2084  alpha/beta fold family hydrolase N  25.86 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  31.97 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  29.47 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  27.89 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4295  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0269643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  25.51 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  26.97 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  28.85 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  24.81 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  25.43 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  25.43 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  25.43 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  25.43 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  25.43 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  25.43 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1334  hydrolase with alpha/beta fold  24.77 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.706412  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  25 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  25.43 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  26.24 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2250  hypothetical protein  30.09 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0744854  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00228  hypothetical protein  30.97 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  25.42 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  28.57 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  26.25 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3184  hypothetical protein  30.06 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  24.32 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2922  hypothetical protein  24.23 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3153  hypothetical protein  27.6 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.913787  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  26.1 
 
 		 298 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0348  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.46 
 
 		 205 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  25.2 
 
 		 297 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  24.3 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0376  alpha/beta hydrolase fold protein  30.97 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.338833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>