154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0633 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  593  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  35.98 
 
 
266 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  39.5 
 
 
274 aa  115  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  33.51 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  33.51 
 
 
265 aa  115  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  38.3 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  31.01 
 
 
287 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  33.01 
 
 
285 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  31.53 
 
 
282 aa  105  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  37.13 
 
 
279 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  32.31 
 
 
278 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  33.65 
 
 
279 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  29.83 
 
 
275 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  32.73 
 
 
315 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  29.21 
 
 
278 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  29.28 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  28.44 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  31.8 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  30.52 
 
 
276 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  30.41 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  33.82 
 
 
285 aa  92.4  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  31.16 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  28.36 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  29.17 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0358  hypothetical protein  32.31 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233875  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3184  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  27.96 
 
 
306 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  23.91 
 
 
267 aa  89  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  27.23 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  32.07 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  32.39 
 
 
286 aa  86.3  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  27.64 
 
 
299 aa  85.9  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  30.05 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0482  hydrolase of the alpha/beta superfamily  30.61 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0662813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  29.41 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  27.66 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  32.39 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3465  hypothetical protein  32.62 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  30.2 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3977  hypothetical protein  28.85 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  26.07 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2272  hypothetical protein  29.78 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  32.65 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  32.65 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  32.65 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  32.08 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  30.69 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2250  hypothetical protein  36.57 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0744854  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  28.24 
 
 
276 aa  79  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  33.11 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.38 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  32.53 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  34.57 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  29.76 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40120  predicted protein  30.96 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98867  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  25.51 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2105  hypothetical protein  35.39 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290661  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3993  hypothetical protein  30.17 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0129209  normal  0.0990612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  25.82 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  29.63 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  28.12 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  29.13 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  27.23 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  27.37 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  29.88 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  25.1 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  25.1 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  25.1 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  26.36 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  30.23 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  25.33 
 
 
266 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3674  hypothetical protein  29.32 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0158425  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3869  hypothetical protein  26.05 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  25 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  26.67 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  28.19 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  22.71 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  22.71 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  22.71 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  22.71 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  22.71 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  23.14 
 
 
284 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.13 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  22.71 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  22.71 
 
 
284 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  27.49 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  26.73 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  29.52 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3153  hypothetical protein  26.52 
 
 
257 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.913787  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  22.27 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  34.97 
 
 
304 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3599  hypothetical protein  24.21 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
305 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  25.13 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  26.26 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  26.14 
 
 
307 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  29.2 
 
 
298 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02210  conserved hypothetical protein  24.14 
 
 
358 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.14 
 
 
286 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4295  hypothetical protein  28.21 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0269643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>