89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3599 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3599  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  578  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3869  hypothetical protein  51.26 
 
 		 287 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00228  hypothetical protein  28.36 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  27.59 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  27.88 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  22.79 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  23.79 
 
 		 278 aa  72  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  25.24 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  23.68 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  24.82 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  25.74 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  24.09 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5044  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.91 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  27 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  26.46 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  24 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  24.55 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  24.78 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0633  hypothetical protein  24.21 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3153  hypothetical protein  26.98 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.913787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  27.47 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  24.03 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  21.78 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3993  hypothetical protein  28.14 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0129209  normal  0.0990612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2845  temperature sensitive supressor-like  26.98 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  29.61 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  29.61 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  29.61 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  24.87 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  28.07 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  23.79 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0187  hypothetical protein  23.83 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3674  hypothetical protein  27.57 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0158425  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2272  hypothetical protein  28.03 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  25 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  23.89 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  24.77 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119577  Protein bem46-like protein  20.65 
 
 		 289 aa  52.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3210  hypothetical protein  22.96 
 
 		 285 aa  52.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  25 
 
 		 284 aa  52.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47043  predicted protein  24.89 
 
 		 281 aa  52.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.33463  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  25.12 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  26.58 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.805173 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  24.32 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  24.32 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  24.32 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  24.32 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  24.32 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2084  alpha/beta fold family hydrolase N  21.72 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  23.74 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1061  temperature sensitive supressor-like protein  25.21 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.133168  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  25.82 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  23.89 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6547  alpha/beta hydrolase BEM46  26.74 
 
 		 268 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1059  RTX protein  28.16 
 
 		 2648 aa  49.3  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  27.37 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  23.74 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  24.14 
 
 		 280 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  22.43 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.74 
 
 		 294 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  22.59 
 
 		 314 aa  49.3  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  26.01 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  27.62 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  24.2 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  25.35 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  22.31 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  23.05 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  25.93 
 
 		 314 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3977  hypothetical protein  27.17 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  27.62 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  25.39 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  21.03 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3824  Esterase/lipase-like protein  28.12 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00729538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  25.2 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  20.25 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  24.17 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  23.89 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  22.83 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  22.83 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  22.83 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  23.35 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.81 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.34 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0482  hydrolase of the alpha/beta superfamily  24.04 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0662813 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40120  predicted protein  24.7 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.98867  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6153  hypothetical protein  25.11 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  22.6 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  29.91 
 
 		 310 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4295  hypothetical protein  25.9 
 
 		 289 aa  42.4  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0269643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>