142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0071 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0071  cobalt-precorrin-6A synthase  100 
 
 
375 aa  744    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.328807  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1021  cobalt-precorrin-6A synthase  77.38 
 
 
365 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2776  cobalt-precorrin-6A synthase  76 
 
 
373 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0441  cobalt-precorrin-6A synthase  78.8 
 
 
367 aa  512  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246554  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0476  cobalt-precorrin-6A synthase  78.8 
 
 
367 aa  512  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2160  cobalt-precorrin-6A synthase  75.48 
 
 
365 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.105122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2297  cobalt-precorrin-6A synthase  67.66 
 
 
381 aa  455  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327427  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1690  cobalt-precorrin-6A synthase  64.25 
 
 
393 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3133  cobalt-precorrin-6A synthase  60.8 
 
 
381 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3740  cobalt-precorrin-6A synthase  64.53 
 
 
388 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.72099  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1315  cobalamin biosynthesis protein CbiD  49.6 
 
 
403 aa  262  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0568  cobalt-precorrin-6A synthase  44.72 
 
 
413 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  46.76 
 
 
388 aa  246  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0538699  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0641  cobalt-precorrin-6A synthase  43.78 
 
 
413 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0807  cobalamin biosynthesis protein CbiD  46.83 
 
 
353 aa  242  7e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2704  cobalt-precorrin-6A synthase  50.82 
 
 
380 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197164  hitchhiker  0.000132557 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0083  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.45 
 
 
361 aa  239  4e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.25516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1268  cobalt-precorrin-6A synthase  44.74 
 
 
411 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1554  cobalt-precorrin-6A synthase  46.5 
 
 
365 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.998598  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2612  cobalt-precorrin-6A synthase  45.21 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0804  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.65 
 
 
410 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2115  cobalt-precorrin-6A synthase  42.31 
 
 
363 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.69193  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1159  cobalt-precorrin-6A synthase  42.31 
 
 
363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1600  cobalt-precorrin-6A synthase  42.31 
 
 
364 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00632738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1953  cobalt-precorrin-6A synthase  42.31 
 
 
364 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0143798  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1970  cobalt-precorrin-6A synthase  42.31 
 
 
364 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2131  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  39.73 
 
 
437 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4479  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.43 
 
 
360 aa  199  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.065352  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1286  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  40.91 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1247  cobalt-precorrin-6A synthase  40.17 
 
 
372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894006  normal  0.951356 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4887  cobalt-precorrin-6A synthase  41.45 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151074  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4621  cobalt-precorrin-6A synthase  41.64 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.199142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4709  cobalt-precorrin-6A synthase  41.83 
 
 
364 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.783318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4831  cobalt-precorrin-6A synthase  41.5 
 
 
364 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0378133  normal  0.576508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2396  cobalt-precorrin-6A synthase  42.04 
 
 
363 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2080  cobalamin biosynthesis protein  40.65 
 
 
371 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0557  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  40.32 
 
 
351 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.382508  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2522  cobalt-precorrin-6A synthase  50.55 
 
 
380 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0994742  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0478  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  43.99 
 
 
369 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5367  cobalt-precorrin-6A synthase  42.17 
 
 
365 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.868467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4419  cobalt-precorrin-6A synthase  41.78 
 
 
370 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4879  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.7 
 
 
370 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0602  cobalt-precorrin-6A synthase  40.51 
 
 
365 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.533643  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1594  cobalt-precorrin-6A synthase  41.59 
 
 
362 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4827  cobalt-precorrin-6A synthase  42.11 
 
 
362 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0976791 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1566  cobalt-precorrin-6A synthase  42.24 
 
 
362 aa  185  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169694  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  41.33 
 
 
602 aa  184  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2996  cobalt-precorrin-6A synthase  43.32 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1196  cobalt-precorrin-6A synthase  41.59 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530086  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1676  cobalt-precorrin-6A synthase  41.59 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00978786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1295  cobalt-precorrin-6A synthase  39.82 
 
 
381 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1649  cobalt-precorrin-6A synthase  41.59 
 
 
362 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3610  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.3 
 
 
356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1887  cobalt-precorrin-6A synthase  42.41 
 
 
368 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1088  cobalt-precorrin-6A synthase  40.48 
 
 
365 aa  182  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.042526  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1576  cobalt-precorrin-6A synthase  41.58 
 
 
363 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0770059  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0798  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.87 
 
 
369 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26470  cobalt-precorrin-6A synthase  42.39 
 
 
366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000249363  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0034  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.82 
 
 
369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2997  cobalamin biosynthesis protein CbiD  42.49 
 
 
362 aa  180  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1978  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  39.73 
 
 
489 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1856  cobalamin biosynthesis protein CbiD  39.17 
 
 
369 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1297  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  39.65 
 
 
392 aa  179  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3544  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.97 
 
 
356 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.762429  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0261  cobalt-precorrin-6A synthase  42.48 
 
 
319 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153251  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3141  cobalt-precorrin-6A synthase  40.41 
 
 
366 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2246  cobalt-precorrin-6A synthase  41.73 
 
 
366 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2714  cobalt-precorrin-6A synthase  40.98 
 
 
370 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5597  cobalamin biosynthetic protein  41.44 
 
 
357 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0631925  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0565  cobalamin biosynthesis protein CbiD  41.64 
 
 
363 aa  172  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1929  cobalt-precorrin-6A synthase  41.52 
 
 
373 aa  172  9e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311511  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1716  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.34 
 
 
362 aa  170  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.3857  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3277  cobalt-precorrin-6A synthase  40.49 
 
 
376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3378  cobalt-precorrin-6A synthase  38.1 
 
 
384 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.159325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2423  cobalt-precorrin-6A synthase  43.83 
 
 
421 aa  166  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.293078  normal  0.546954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2627  cobalt-precorrin-6A synthase  38.87 
 
 
353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.049841  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3153  cobalt-precorrin-6A synthase  39.67 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3517  cobalamin biosynthesis protein CbiD  43.12 
 
 
367 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0698  cobalt-precorrin-6A synthase  34.54 
 
 
352 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1691  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  41.8 
 
 
349 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0471998  normal  0.0290062 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1009  cobalamin biosynthesis protein CbiD  36.75 
 
 
365 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1298  cobalt-precorrin-6A synthase  41.77 
 
 
368 aa  159  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1261  cobalt-precorrin-6A synthase  41.9 
 
 
368 aa  159  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2454  cobalt-precorrin-6A synthase  42.32 
 
 
364 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.802766  normal  0.0612278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1290  cobalt-precorrin-6A synthase  41.43 
 
 
373 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.191656 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2359  cobalamin biosynthesis protein CbiD  37.33 
 
 
371 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1174  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiD protein  45.89 
 
 
449 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.793158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2158  cobalt-precorrin-6A synthase  39.44 
 
 
364 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2208  cobalt-precorrin-6A synthase  36.72 
 
 
379 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.206657  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2154  cobalt-precorrin-6A synthase  36.72 
 
 
379 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.373761  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2201  cobalt-precorrin-6A synthase  36.72 
 
 
379 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2254  cobalt-precorrin-6A synthase  36.72 
 
 
379 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.537734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2367  cobalt-precorrin-6A synthase  36.72 
 
 
379 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0309  cobalt-precorrin-6A synthase  34.63 
 
 
366 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1434  cobalt-precorrin-6A synthase  34.71 
 
 
365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.620217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1270  cobalamin biosynthesis protein CbiD  33.05 
 
 
384 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0931  cobalamin biosynthesis protein CbiD  40.06 
 
 
576 aa  153  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.738737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1240  cobalt-precorrin-6A synthase  33.82 
 
 
365 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.178409  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1719  cobalt-precorrin-6A synthase  38.33 
 
 
383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0622  cobalamin biosynthesis D transmembrane protein  34.82 
 
 
383 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>