More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1027 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  100 
 
 
456 aa  924    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  42.47 
 
 
476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  36.97 
 
 
464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  43.42 
 
 
469 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  43.17 
 
 
463 aa  298  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  35.9 
 
 
446 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  38.71 
 
 
474 aa  279  6e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  34.45 
 
 
467 aa  277  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  38.44 
 
 
462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  37.28 
 
 
467 aa  272  7e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  38.34 
 
 
466 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  35.53 
 
 
437 aa  270  4e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  35.39 
 
 
437 aa  263  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  35.39 
 
 
437 aa  263  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  36.73 
 
 
444 aa  259  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  38.9 
 
 
458 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  36.52 
 
 
446 aa  251  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  39.18 
 
 
463 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  39.01 
 
 
455 aa  239  5.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  38.59 
 
 
744 aa  235  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  35.02 
 
 
443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  34.22 
 
 
445 aa  233  7.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  36.87 
 
 
491 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  38.98 
 
 
436 aa  229  8e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.94 
 
 
449 aa  228  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  31.79 
 
 
445 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  32.21 
 
 
451 aa  226  7e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  32.21 
 
 
451 aa  226  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  33.78 
 
 
447 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  33.71 
 
 
445 aa  216  5.9999999999999996e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  38.21 
 
 
474 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  33.02 
 
 
448 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  33.02 
 
 
448 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  37 
 
 
507 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  32.43 
 
 
455 aa  211  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  34.23 
 
 
441 aa  211  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  35.24 
 
 
445 aa  204  3e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  33.87 
 
 
447 aa  203  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  34.67 
 
 
452 aa  201  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  33.77 
 
 
430 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  32.1 
 
 
490 aa  156  9e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  30.39 
 
 
445 aa  154  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  32.38 
 
 
429 aa  146  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  34.13 
 
 
416 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  31.63 
 
 
429 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  33.51 
 
 
417 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  30.9 
 
 
412 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  34.64 
 
 
408 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  34.45 
 
 
394 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  29.95 
 
 
470 aa  135  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  32.92 
 
 
424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  31.23 
 
 
418 aa  134  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  31.84 
 
 
418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  28.09 
 
 
472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  30.08 
 
 
411 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  32.91 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  31.46 
 
 
408 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  31.46 
 
 
408 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  32.32 
 
 
413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  33 
 
 
412 aa  126  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  32.98 
 
 
425 aa  126  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  30.96 
 
 
408 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  32.16 
 
 
406 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  33.49 
 
 
421 aa  123  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  29.47 
 
 
410 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  29.23 
 
 
420 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  29.23 
 
 
415 aa  97.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2613  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  28.31 
 
 
473 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00649562  unclonable  0.00000000000596507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0463  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.25 
 
 
469 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.132018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0693  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  30.37 
 
 
476 aa  65.1  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.319702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2925  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  27.48 
 
 
471 aa  64.7  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000583962  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1273  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  26.06 
 
 
498 aa  63.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.955729  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3788  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  30.29 
 
 
468 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0893617  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2978  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  29.63 
 
 
475 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2609  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  22.37 
 
 
493 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000060186 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0755  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2,6- diamin opimelate/D-alanyl-D-alanylligase  22.26 
 
 
444 aa  59.3  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0553781  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3127  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.31 
 
 
471 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0355  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.24 
 
 
484 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000792879 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2371  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  22.15 
 
 
493 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00139261  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3452  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.89 
 
 
484 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1119  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.52 
 
 
465 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2414  Mur ligase family protein  22.96 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00339863  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0243  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  24.46 
 
 
459 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.390726  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00903  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.36 
 
 
485 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0893  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/ D-alanyl-D-alanyl ligase  31.05 
 
 
482 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1978  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  32.54 
 
 
486 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0586657  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004489  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  27.99 
 
 
485 aa  57.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276736  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3543  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.52 
 
 
465 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0949  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  29.3 
 
 
481 aa  57.4  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3524  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.52 
 
 
465 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3549  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.52 
 
 
465 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3416  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.04 
 
 
478 aa  57.4  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.971134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2705  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  26.07 
 
 
511 aa  56.6  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.234649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2835  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.41 
 
 
465 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0068259  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2095  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  34.21 
 
 
450 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0892669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0471  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.52 
 
 
465 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0489  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.41 
 
 
465 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455446  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1330  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  28.52 
 
 
465 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.837457  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2192  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  31.3 
 
 
479 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.604206  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0464  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.41 
 
 
465 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.300994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>