41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_00767 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00767  small nuclear ribonucleoprotein (LSM7), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14290)  100 
 
 		 136 aa  270  5.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46810  predicted protein  61.22 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.200547 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42488  predicted protein  55.43 
 
 		 100 aa  107  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.357284  normal  0.0185281 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03890  U6 snRNA binding protein, putative  60.98 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.556967  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8840  predicted protein  54.95 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.741263  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2102  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  41.11 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01495  small nuclear ribonucleoprotein SmG, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04960)  44.78 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42364  predicted protein  39.29 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0179041  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2251  like-Sm ribonucleoprotein, core  51.67 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.133876 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1814  Like-Sm ribonucleoprotein core  44.44 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27053  predicted protein  45 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0249018  hitchhiker  0.000208851 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0421  like-Sm ribonucleoprotein, core  44.93 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2332  like-Sm ribonucleoprotein, core  40 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00160681  hitchhiker  0.000613176 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0692  like-Sm ribonucleoprotein, core  38.1 
 
 		 86 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0149  hypothetical protein  42.86 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00289239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32889  predicted protein  35.71 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1974  like-Sm ribonucleoprotein core  38.1 
 
 		 86 aa  49.7  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.470211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63621  predicted protein  35.71 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.733527  normal  0.260452 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0230  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.18 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299461  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2141  LSM family small nuclear ribonucleoprotein  44.44 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10752  predicted protein  35.53 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10561  small nuclear ribonucleoprotein SmB, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07740)  36.9 
 
 		 196 aa  47.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.199439 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2181  small nuclear ribonucleoprotein  41.18 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0038  like-Sm ribonucleoprotein core  42.86 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00385043 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1081  like-Sm ribonucleoprotein, core  42.86 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.555399  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03360  hypothetical protein  35 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389414  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10007  U6 small nuclear ribonucleoprotein (Lsm3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12570)  39.24 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0093  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.73 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20588  predicted protein  42.37 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3500  small nuclear ribonucleoprotein  45.59 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0690135  normal  0.488094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3059  like-Sm ribonucleoprotein, core  37.1 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0041  like-Sm ribonucleoprotein, core  39.68 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.444041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43771  predicted protein  33.75 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1529  like-Sm ribonucleoprotein core  37.68 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0396  Like-Sm ribonucleoprotein core  39.34 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0297604 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1391  Like-Sm ribonucleoprotein core  34.78 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.219632  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0221  like-Sm ribonucleoprotein core  38.24 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0866  like-Sm ribonucleoprotein core  38.1 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0232  small nuclear ribonucleoprotein  39.71 
 
 		 71 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.317695  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02650  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 		 195 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0190599  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07590  Sm-like protein, putative  32.93 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>