2422 genes were found for organism Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BamMC406_3103  CDS  NC_010552  280  639  -  360  arsenate reductase  YP_001809794  hitchhiker  0.000012138  normal  0.181739  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3104  CDS  NC_010552  934  1056  +  123  hypothetical protein  YP_001809795  hitchhiker  0.000309634  normal  0.168718  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3105  CDS  NC_010552  1401  1505  -  105  hypothetical protein  YP_001809796  hitchhiker  0.0027357  normal  0.171492  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3106  CDS  NC_010552  1638  2300  +  663  cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001809797  normal  0.0528663  normal  0.2717  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3107  CDS  NC_010552  2324  3385  +  1062  parB-like partition protein  YP_001809798  normal  0.33324  normal  0.297937  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3108  CDS  NC_010552  3477  4841  -  1365  hypothetical protein  YP_001809799  normal  0.754423  normal  0.245569  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3109  CDS  NC_010552  4890  5750  +  861  hypothetical protein  YP_001809800  normal  0.757548  normal  0.214038  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3110    NC_010552  5755  6297  +  543      normal  0.604282  normal  0.196566  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3111  CDS  NC_010552  6663  7844  +  1182  hypothetical protein  YP_001809801  normal  1  normal  0.211252  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3112  CDS  NC_010552  7985  8998  -  1014  integrase family protein  YP_001809802  normal  1  normal  0.295128  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3113  CDS  NC_010552  9108  9485  -  378  hypothetical protein  YP_001809803  normal  0.857162  normal  0.337109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3114  CDS  NC_010552  9613  10224  -  612  XRE family transcriptional regulator  YP_001809804  normal  0.935644  normal  0.475898  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3115  CDS  NC_010552  10386  11585  +  1200  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  YP_001809805  normal  0.601738  normal  0.545145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3116  CDS  NC_010552  11599  12627  +  1029  L-threonine 3-dehydrogenase  YP_001809806  normal  1  normal  0.717555  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3117  CDS  NC_010552  13344  13958  +  615  TetR family transcriptional regulator  YP_001809807  normal  1  normal  0.490432  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3118  CDS  NC_010552  14014  14493  +  480  hypothetical protein  YP_001809808  normal  1  normal  0.49314  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3119  CDS  NC_010552  14993  16078  -  1086  tartrate dehydrogenase  YP_001809809  normal  1  normal  0.560856  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3120  CDS  NC_010552  16127  17119  +  993  LysR family transcriptional regulator  YP_001809810  normal  1  normal  0.540342  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3121  CDS  NC_010552  17280  18254  -  975  N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase  YP_001809811  normal  1  normal  0.404008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3122  CDS  NC_010552  18347  19231  +  885  LysR family transcriptional regulator  YP_001809812  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3123  CDS  NC_010552  19387  19851  -  465  hypothetical protein  YP_001809813  normal  1  normal  0.862887  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3124  CDS  NC_010552  19912  21129  -  1218  patatin  YP_001809814  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3125  CDS  NC_010552  21260  22045  -  786  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  YP_001809815  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3126  CDS  NC_010552  22097  22837  -  741  acetoacetate decarboxylase  YP_001809816  normal  0.898077  normal  0.894092  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3127  CDS  NC_010552  23281  23862  +  582  phosphoesterase PA-phosphatase related  YP_001809817  normal  0.634869  normal  0.862887  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3128  CDS  NC_010552  23898  24122  -  225  hypothetical protein  YP_001809818  normal  0.353832  normal  0.826698  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3129  CDS  NC_010552  24242  25063  -  822  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  YP_001809819  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3130  CDS  NC_010552  25102  25815  -  714  PadR-like family transcriptional regulator  YP_001809820  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3131  CDS  NC_010552  26621  27622  +  1002  FHA domain-containing protein  YP_001809821  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3132  CDS  NC_010552  27619  31668  +  4050  serine/threonine protein kinase  YP_001809822  normal  0.28005  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3133  CDS  NC_010552  31702  32046  +  345  hypothetical protein  YP_001809823  normal  0.0181293  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3134  CDS  NC_010552  32063  32425  +  363  hypothetical protein  YP_001809824  normal  0.0184586  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3135  CDS  NC_010552  32520  34757  +  2238  hypothetical protein  YP_001809825  normal  0.535305  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3136  CDS  NC_010552  34878  35453  -  576  hypothetical protein  YP_001809826  normal  0.594994  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3137  CDS  NC_010552  35725  36675  -  951  AraC family transcriptional regulator  YP_001809827  normal  0.806446  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3138  CDS  NC_010552  37061  38659  +  1599  glucose-methanol-choline oxidoreductase  YP_001809828  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3139  CDS  NC_010552  38701  40188  +  1488  aldehyde dehydrogenase  YP_001809829  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3140  CDS  NC_010552  40258  41349  -  1092  outer membrane protein (porin)  YP_001809830  normal  0.448151  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3141  CDS  NC_010552  41528  42250  -  723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001809831  normal  0.76943  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3142  CDS  NC_010552  42228  43349  -  1122  alcohol dehydrogenase  YP_001809832  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3143  CDS  NC_010552  43351  44652  -  1302  major facilitator transporter  YP_001809833  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3144  CDS  NC_010552  44671  45204  -  534  cupin 2 domain-containing protein  YP_001809834  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3145  CDS  NC_010552  45392  46357  +  966  AraC family transcriptional regulator  YP_001809835  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3146  CDS  NC_010552  46561  47508  -  948  aldo/keto reductase  YP_001809836  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3147  CDS  NC_010552  47883  48503  -  621  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_001809837  normal  0.294591  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3148  CDS  NC_010552  48609  49502  +  894  chromosome replication initiation inhibitor protein  YP_001809838  normal  0.99123  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3149  CDS  NC_010552  49571  50320  -  750  Crp/FNR family transcriptional regulator  YP_001809839  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3150  CDS  NC_010552  50484  50951  -  468  UspA domain-containing protein  YP_001809840  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3151  CDS  NC_010552  51585  51995  -  411  hypothetical protein  YP_001809841  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3152  CDS  NC_010552  52274  52507  +  234  hypothetical protein  YP_001809842  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3153  CDS  NC_010552  52651  53571  +  921  Serine O-acetyltransferase  YP_001809843  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3154  CDS  NC_010552  53604  54407  -  804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001809844  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3155  CDS  NC_010552  54407  55036  -  630  GTP cyclohydrolase I  YP_001809845  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3156  CDS  NC_010552  55138  56064  -  927  LysR family transcriptional regulator  YP_001809846  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3157  CDS  NC_010552  56181  57413  +  1233  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  YP_001809847  normal  0.65281  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3158  CDS  NC_010552  57558  58274  +  717  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  YP_001809848  normal  0.913746  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3159  CDS  NC_010552  58294  58950  +  657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  YP_001809849  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3160  CDS  NC_010552  59039  60412  +  1374  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  YP_001809850  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3161  CDS  NC_010552  60412  61197  +  786  3-oxoadipate enol-lactonase  YP_001809851  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3162  CDS  NC_010552  61208  61594  +  387  4-carboxymuconolactone decarboxylase  YP_001809852  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3163  CDS  NC_010552  61831  63189  +  1359  major facilitator transporter  YP_001809853  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3164  CDS  NC_010552  63312  63572  -  261  hypothetical protein  YP_001809854  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3165  CDS  NC_010552  63669  64286  -  618  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_001809855  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3166  CDS  NC_010552  64875  66242  -  1368  hypothetical protein  YP_001809856  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3167  CDS  NC_010552  67463  67672  -  210  hypothetical protein  YP_001809857  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3168  CDS  NC_010552  67692  68099  -  408  hypothetical protein  YP_001809858  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3169    NC_010552  68198  68428  -  231      normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3170  CDS  NC_010552  68943  69656  +  714  hypothetical protein  YP_001809859  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3171  CDS  NC_010552  69936  70568  +  633  hypothetical protein  YP_001809860  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3172  CDS  NC_010552  70565  71965  +  1401  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  YP_001809861  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3173  CDS  NC_010552  72402  73571  +  1170  hypothetical protein  YP_001809862  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3174  CDS  NC_010552  73576  75477  +  1902  hypothetical protein  YP_001809863  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3175  CDS  NC_010552  75474  78638  +  3165  hypothetical protein  YP_001809864  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3176  CDS  NC_010552  78604  79533  +  930  DNA/RNA non-specific endonuclease  YP_001809865  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3177  CDS  NC_010552  79546  79791  +  246  hypothetical protein  YP_001809866  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3178  CDS  NC_010552  80138  81193  +  1056  hypothetical protein  YP_001809867  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3179  CDS  NC_010552  81253  81561  -  309  hypothetical protein  YP_001809868  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3180  CDS  NC_010552  82379  82636  +  258  hypothetical protein  YP_001809869  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3181  CDS  NC_010552  82714  82983  -  270  hypothetical protein  YP_001809870  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3182  CDS  NC_010552  83199  83735  +  537  hypothetical protein  YP_001809871  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3183  CDS  NC_010552  83806  84156  +  351  hypothetical protein  YP_001809872  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3184  CDS  NC_010552  84256  84567  +  312  hypothetical protein  YP_001809873  normal  0.692421  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3185  CDS  NC_010552  85114  86256  +  1143  hypothetical protein  YP_001809874  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3186  CDS  NC_010552  86862  87578  +  717  hypothetical protein  YP_001809875  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3187  CDS  NC_010552  88013  88417  -  405  hypothetical protein  YP_001809876  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3188  CDS  NC_010552  88929  90617  +  1689  hypothetical protein  YP_001809877  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3189  CDS  NC_010552  90916  91824  -  909  LysR family transcriptional regulator  YP_001809878  normal  0.77747  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3190  CDS  NC_010552  91946  92659  +  714  ThiJ/PfpI domain-containing protein  YP_001809879  normal  0.687105  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3191  CDS  NC_010552  92681  93523  +  843  ThiJ/PfpI domain-containing protein  YP_001809880  normal  0.385188  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3192  CDS  NC_010552  93581  94375  +  795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001809881  normal  0.367589  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3193  CDS  NC_010552  94919  95470  +  552  hypothetical protein  YP_001809882  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3194  CDS  NC_010552  95502  95816  +  315  blue (type1) copper domain-containing protein  YP_001809883  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3195  CDS  NC_010552  95813  96517  +  705  RNA polymerase sigma factor  YP_001809884  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3196  CDS  NC_010552  96541  97320  -  780  PGAP1 family protein  YP_001809885  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3197  CDS  NC_010552  97317  98471  -  1155  hypothetical protein  YP_001809886  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3198  CDS  NC_010552  98660  99838  -  1179  chromate transporter  YP_001809887  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3199  CDS  NC_010552  99835  100812  -  978  chromate resistance exported protein  YP_001809888  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3200  CDS  NC_010552  100997  101269  +  273  hypothetical protein  YP_001809889  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3201  CDS  NC_010552  101281  102573  +  1293  cation diffusion facilitator family transporter  YP_001809890  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
BamMC406_3202  CDS  NC_010552  102576  102761  +  186  hypothetical protein  YP_001809891  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>