25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3134 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3134  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  253  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0184586  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4991  hypothetical protein  99.17 
 
 
120 aa  251  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4505  hypothetical protein  94.17 
 
 
120 aa  239  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.980342  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5137  hypothetical protein  94.17 
 
 
120 aa  239  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0129072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5722  hypothetical protein  94.17 
 
 
120 aa  239  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117475  normal  0.375507 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2215  hypothetical protein  55.28 
 
 
120 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.965599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2492  hypothetical protein  55.28 
 
 
120 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0636  hypothetical protein  55.28 
 
 
120 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0621  hypothetical protein  55.28 
 
 
120 aa  140  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107955  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2868  hypothetical protein  55.28 
 
 
120 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0516  hypothetical protein  54.47 
 
 
120 aa  124  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0725362  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4990  hypothetical protein  35.78 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3133  hypothetical protein  35.78 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181293  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5721  hypothetical protein  35.78 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152546  normal  0.365486 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5138  hypothetical protein  35.78 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00518723  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4506  hypothetical protein  35.78 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795055  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4366  hypothetical protein  35 
 
 
261 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340017  normal  0.0984288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0515  hypothetical protein  32.93 
 
 
120 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423377  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3065  hypothetical protein  31.4 
 
 
265 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560449  normal  0.0755351 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2867  hypothetical protein  31.71 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0021  hypothetical protein  31.71 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599632  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2216  hypothetical protein  29.58 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0620  ABC transporter ATPase  31.71 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679785  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0635  hypothetical protein  31.71 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2491  hypothetical protein  31.71 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>