17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3152 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5011  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461338  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3152  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3135  hypothetical protein  98.7 
 
 
77 aa  159  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5119  hypothetical protein  96.1 
 
 
77 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312616  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5740  hypothetical protein  96.1 
 
 
77 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.986271  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4483  hypothetical protein  96.1 
 
 
77 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5294  hypothetical protein  92.21 
 
 
77 aa  150  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1193  hypothetical protein  90.54 
 
 
78 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0040  hypothetical protein  90.54 
 
 
78 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0061  hypothetical protein  90.54 
 
 
78 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.950758  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0048  hypothetical protein  90.54 
 
 
78 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0050  hypothetical protein  90.54 
 
 
78 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.754201  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0040  hypothetical protein  89.19 
 
 
78 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0615  hypothetical protein  83.12 
 
 
77 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0812059 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4450  hypothetical protein  79.22 
 
 
77 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.775486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4286  hypothetical protein  80.52 
 
 
77 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.259854 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1477  hypothetical protein  87.5 
 
 
64 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.57497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>