35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3111 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3111  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  785    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.211252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0002  hypothetical protein  88.49 
 
 		 393 aa  702    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4540  hypothetical protein  88.49 
 
 		 393 aa  704    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.711481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5697  hypothetical protein  88.27 
 
 		 393 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908607  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5162  hypothetical protein  88.27 
 
 		 393 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4968  hypothetical protein  98.98 
 
 		 393 aa  777    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3159  hypothetical protein  84.44 
 
 		 393 aa  675    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0001  hypothetical protein  72.01 
 
 		 395 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0001  hypothetical protein  72.01 
 
 		 395 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0001  chromosome segregation ATPases  72.01 
 
 		 395 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.374592  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1427  hypothetical protein  72.01 
 
 		 395 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1147  hypothetical protein  72.01 
 
 		 395 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.014535  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0002  hypothetical protein  72.01 
 
 		 395 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1506  hypothetical protein  72.01 
 
 		 395 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0597972  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0001  hypothetical protein  70.99 
 
 		 395 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7008  hypothetical protein  61.89 
 
 		 401 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4155  hypothetical protein  61.64 
 
 		 401 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3025  hypothetical protein  58.38 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1887  hypothetical protein  26.76 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.949228 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7283  hypothetical protein  28.68 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0877183  normal  0.0144014 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1608  hypothetical protein  31.41 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146212  normal  0.149131 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4402  hypothetical protein  35.23 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3965  hypothetical protein  35.23 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5956  hypothetical protein  35.23 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.981401 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4450  putative KfrA protein  26.49 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.266051  normal  0.158271 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4340  hypothetical protein  26.49 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.748561  normal  0.706664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1738  hypothetical protein  26.49 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.432108 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5043  putative KfrA protein  26.49 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.206291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4222  hypothetical protein  32 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.828479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2033  hypothetical protein  33.15 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100431 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7323  hypothetical protein  27.2 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0722826 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5788  hypothetical protein  32.61 
 
 		 220 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1626  hypothetical protein  27.52 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6381  hypothetical protein  25.47 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779943  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6346  hypothetical protein  25.49 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00483484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>