48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3126 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3126  acetoacetate decarboxylase  100 
 
 		 246 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898077  normal  0.894092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4983  acetoacetate decarboxylase  100 
 
 		 246 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3166  acetoacetate decarboxylase  97.15 
 
 		 246 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4525  acetoacetate decarboxylase  96.75 
 
 		 246 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5311  acetoacetate decarboxylase  96.75 
 
 		 246 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5145  acetoacetate decarboxylase  96.75 
 
 		 246 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5714  acetoacetate decarboxylase  96.75 
 
 		 246 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176105  normal  0.138686 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0024  acetoacetate decarboxylase  88.21 
 
 		 313 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0919679  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0020  acetoacetate decarboxylase  88.62 
 
 		 246 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1168  acetoacetate decarboxylase  88.21 
 
 		 313 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0022  acetoacetate decarboxylase  88.21 
 
 		 313 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0022  acetoacetate decarboxylase  88.21 
 
 		 246 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1448  acetoacetate decarboxylase  88.21 
 
 		 246 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1525  acetoacetate decarboxylase  88.21 
 
 		 246 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0018  acetoacetate decarboxylase  88.21 
 
 		 246 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2916  acetoacetate decarboxylase  80.49 
 
 		 252 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1567  acetoacetate decarboxylase  80.49 
 
 		 252 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1058  acetoacetate decarboxylase  78.14 
 
 		 247 aa  400  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4271  acetoacetate decarboxylase  78.14 
 
 		 247 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.13698  normal  0.618993 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4381  acetoacetate decarboxylase  78.14 
 
 		 247 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.602468  normal  0.211813 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6203  acetoacetate decarboxylase  69.51 
 
 		 246 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0495  acetoacetate decarboxylase  68.98 
 
 		 245 aa  354  5.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2695  acetoacetate decarboxylase  66.67 
 
 		 246 aa  354  6.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal  0.885884 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2114  acetoacetate decarboxylase  63.2 
 
 		 250 aa  334  5.999999999999999e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1411  acetoacetate decarboxylase  68.95 
 
 		 263 aa  334  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305787  normal  0.188243 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2132  acetoacetate decarboxylase  63.93 
 
 		 249 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5526  acetoacetate decarboxylase  63.71 
 
 		 267 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.0278315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1397  acetoacetate decarboxylase  65.71 
 
 		 257 aa  323  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0671592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5563  acetoacetate decarboxylase  62.5 
 
 		 259 aa  323  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3919  acetoacetate decarboxylase  63.86 
 
 		 251 aa  322  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2412  acetoacetate decarboxylase  60.89 
 
 		 259 aa  319  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.652307 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01634  acetoacetate decarboxylase  57.66 
 
 		 273 aa  291  6e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0708  acetoacetate decarboxylase  59.03 
 
 		 254 aa  288  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0728  acetoacetate decarboxylase  55.69 
 
 		 254 aa  288  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1938  acetoacetate decarboxylase  52.77 
 
 		 245 aa  255  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4592  acetoacetate decarboxylase  51.25 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.999552  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3628  acetoacetate decarboxylase  50 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7618  Acetoacetate decarboxylase  33.2 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0117  Acetoacetate decarboxylase  35.74 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187521  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2286  Acetoacetate decarboxylase  27.67 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7640  hypothetical protein  26.45 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.323453 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1128  hypothetical protein  26.39 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.219472  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2366  hypothetical protein  31.97 
 
 		 268 aa  48.9  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.138399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0744  Acetoacetate decarboxylase  28.97 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02690  acetoacetate decarboxylase  30.97 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7498  acetoacetate decarboxylase  26.51 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0763  acetoacetate decarboxylase  27.83 
 
 		 288 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.325494  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5319  hypothetical protein  22.67 
 
 		 296 aa  42  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.519767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>