24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3133 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3133  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  236  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4990  hypothetical protein  98.25 
 
 		 114 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4506  hypothetical protein  89.47 
 
 		 114 aa  214  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5138  hypothetical protein  88.6 
 
 		 114 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00518723  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5721  hypothetical protein  88.6 
 
 		 114 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152546  normal  0.365486 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0515  hypothetical protein  58.49 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2491  hypothetical protein  54.95 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0635  hypothetical protein  54.95 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2867  hypothetical protein  54.95 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0620  ABC transporter ATPase  54.95 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0679785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0021  hypothetical protein  54.95 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599632  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2216  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3134  hypothetical protein  35.78 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0184586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4991  hypothetical protein  35.78 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5722  hypothetical protein  34.86 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117475  normal  0.375507 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4505  hypothetical protein  34.86 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.980342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5137  hypothetical protein  34.86 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0129072  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2215  hypothetical protein  33.93 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.965599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2868  hypothetical protein  33.93 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0621  hypothetical protein  33.93 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107955  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0636  hypothetical protein  33.93 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2492  hypothetical protein  33.93 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0516  hypothetical protein  36.61 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0725362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4366  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340017  normal  0.0984288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>