99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3193 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3193  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5048  hypothetical protein  94.54 
 
 		 183 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1215  hypothetical protein  76.1 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1498  hypothetical protein  76.1 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0070  hypothetical protein  76.1 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0071  hypothetical protein  76.1 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0059  hypothetical protein  76.1 
 
 		 182 aa  244  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1565  hypothetical protein  76.73 
 
 		 182 aa  244  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0087  hypothetical protein  76.1 
 
 		 182 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6258  hypothetical protein  69.86 
 
 		 176 aa  204  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2133  hypothetical protein  65.67 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15074  normal  0.357882 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1480  hypothetical protein  45.98 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1789  hypothetical protein  49.32 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2696  hypothetical protein  48 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7491  hypothetical protein  48.63 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766065  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0214  hypothetical protein  46.15 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6436  hypothetical protein  46.94 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4196  hypothetical protein  46.43 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00164803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1440  hypothetical protein  45.58 
 
 		 175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4792  hypothetical protein  42.44 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0989533 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4881  hypothetical protein  41.28 
 
 		 173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3425  outer membrane-like protein  46.94 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109632  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  31.29 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  31.29 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  30.56 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  28.92 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  30.34 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  30.13 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  31.06 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11110  hypothetical protein  28.82 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  32.09 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7435  outer membrane protein-like protein  27.54 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.938816 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3904  hypothetical protein  29.22 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0471754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  29.55 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  30.41 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  28.67 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  28.67 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  28.37 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1324  hypothetical protein  30.88 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  28.38 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6350  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.041892  normal  0.708608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  33.33 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  27.34 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  27.48 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5634  hypothetical protein  28.68 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  33.77 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  32.41 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6382  hypothetical protein  28.68 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.141353  normal  0.501614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  29.73 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  30 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  32.9 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  29.79 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  30.08 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  29.33 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  30.46 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  25.62 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  30.34 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  26.53 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  32.74 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  26.53 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  26.53 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  32.05 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0129  hypothetical protein  29.77 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  30.07 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  27.97 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  27.97 
 
 		 169 aa  47.8  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5562  hypothetical protein  30.3 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425424  normal  0.0185018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5023  hypothetical protein  30.71 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0763629 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3291  hypothetical protein  25.19 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.743277 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1353  hypothetical protein  27.34 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7119  hypothetical protein  31.72 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  0.116456 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0617  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161317  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0925  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2472  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2686  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3132  hypothetical protein  24.55 
 
 		 173 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2389  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4768  hypothetical protein  27.2 
 
 		 190 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3523  hypothetical protein  23.97 
 
 		 226 aa  44.7  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  hitchhiker  0.00178282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  27.48 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4652  hypothetical protein  35.65 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0910  hypothetical protein  22.76 
 
 		 298 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0748  hypothetical protein  27.82 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5115  hypothetical protein  35.65 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.85355  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7395  hypothetical protein  30.63 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967548  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4243  hypothetical protein  26.4 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104978  normal  0.0275996 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5406  hypothetical protein  26.4 
 
 		 192 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3486  hypothetical protein  26.4 
 
 		 192 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.111456  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4880  hypothetical protein  26.4 
 
 		 192 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5348  hypothetical protein  29.13 
 
 		 184 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.956984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  27.14 
 
 		 208 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3550  outer membrane protein  26.85 
 
 		 204 aa  42  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00012513  normal  0.0785876 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  25.55 
 
 		 201 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  25.55 
 
 		 201 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  25.55 
 
 		 201 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  25.55 
 
 		 201 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  25.55 
 
 		 201 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  25.55 
 
 		 201 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>