2742 genes were found for organism Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 28    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
LACR_0001  CDS  NC_008527  144  1508  1365  chromosomal replication initiation protein  YP_808060  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0002  CDS  NC_008527  1665  2807  1143  DNA polymerase III subunit beta  YP_808061  normal  0.376275  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0003  CDS  NC_008527  2913  6212  3300  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  YP_808062  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0004  CDS  NC_008527  6205  9816  3612  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  YP_808063  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0005  CDS  NC_008527  9851  10051  201  hypothetical protein  YP_808064  normal  0.0967393  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0006  CDS  NC_008527  10059  10616  558  XRE family transcriptional regulator  YP_808065  decreased coverage  0.000100303  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0007  CDS  NC_008527  10900  12015  1116  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  YP_808066  normal  0.0312393  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0008  CDS  NC_008527  12127  12450  324  XRE family transcriptional regulator  YP_808067  hitchhiker  0.000363546  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0009  CDS  NC_008527  12882  13856  975  hypothetical protein  YP_808068  normal  0.115503  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0010  CDS  NC_008527  14033  14599  567  peptidyl-tRNA hydrolase  YP_808069  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0011  CDS  NC_008527  14600  18088  3489  transcription-repair coupling factor  YP_808070  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0012  CDS  NC_008527  18405  18674  270  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  YP_808071  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0013  CDS  NC_008527  18705  19079  375  hypothetical protein  YP_808072  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0014  CDS  NC_008527  19079  19402  324  hypothetical protein  YP_808073  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0015  CDS  NC_008527  19543  20880  1338  Beta-lactamase class A  YP_808074  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0016  CDS  NC_008527  20877  22145  1269  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  YP_808075  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0017  CDS  NC_008527  22126  22677  552  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  YP_808076  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0018  CDS  NC_008527  22883  24970  2088  FtsH-2 peptidase  YP_808077  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0027  CDS  NC_008527  26036  27859  1824  phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component  YP_808078  normal  0.03795  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0028  CDS  NC_008527  27919  29853  1935  transcriptional antiterminator  YP_808079  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0029  CDS  NC_008527  29900  30331  432  mannitol/fructose-specific phosphotransferase system IIA protein  YP_808080  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0030  CDS  NC_008527  30480  31646  1167  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  YP_808081  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0031  CDS  NC_008527  31752  32015  264  hypothetical protein  YP_808082  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0032  CDS  NC_008527  32064  32333  270  hypothetical protein  YP_808083  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0033  CDS  NC_008527  32305  33135  831  alpha/beta hydrolase superfamily protein  YP_808084  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0034  CDS  NC_008527  33891  34142  252  hypothetical protein  YP_808085  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0035  CDS  NC_008527  34547  34849  303  hypothetical protein  YP_808086  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0036  CDS  NC_008527  35076  35429  354  hypothetical protein  YP_808087  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0037  CDS  NC_008527  35551  35709  159  hypothetical protein  YP_808088  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0038  CDS  NC_008527  35769  36623  855  transposase  YP_808089  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0039  CDS  NC_008527  36620  36880  261  transposase  YP_808090  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0040  CDS  NC_008527  37363  37815  453  acetyltransferase  YP_808091  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0041  CDS  NC_008527  37900  38142  243  hypothetical protein  YP_808092  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0042  CDS  NC_008527  38236  38847  612  MFS superfamily sulfate permease  YP_808093  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0043  CDS  NC_008527  38844  39854  1011  MFS superfamily sulfate permease  YP_808094  hitchhiker  0.00447407  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0044  CDS  NC_008527  40064  40585  522  acetyltransferase  YP_808095  decreased coverage  6.37954e-05  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0046  CDS  NC_008527  41047  42222  1176  aromatic amino acid aminotransferase  YP_808096  normal  0.0104565  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0047  CDS  NC_008527  42320  43075  756  DNA repair protein RecO  YP_808097  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0048  CDS  NC_008527  43227  44645  1419  dihydrolipoamide dehydrogenase  YP_808098  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0049  CDS  NC_008527  44864  46450  1587  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E2 component, dihydrolipoamide succinyltransferase  YP_808099  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0050  CDS  NC_008527  46443  47423  981  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  YP_808100  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0051  CDS  NC_008527  47426  48550  1125  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, alpha subunit  YP_808101  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0052  CDS  NC_008527  48639  49640  1002  lipoate-protein ligase  YP_808102  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0053  CDS  NC_008527  49833  50687  855  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  YP_808103  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0054  CDS  NC_008527  50687  50785  99  hypothetical protein  YP_808104  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0055    NC_008527  50766  51501  736      normal  0.118347  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0056  CDS  NC_008527  51467  51793  327  hypothetical protein  YP_808105  normal  0.0813659  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0057  CDS  NC_008527  51850  52740  891  transposase  YP_808106  normal  0.033451  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0058  CDS  NC_008527  52893  53918  1026  tryptophanyl-tRNA synthetase II  YP_808107  hitchhiker  0.00653714  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0059  CDS  NC_008527  54417  54854  438  redox protein, regulator of disulfide bond formation  YP_808108  hitchhiker  0.00217443  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0060  CDS  NC_008527  55016  56329  1314  amino acid transporter  YP_808109  normal  0.490002  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0061  CDS  NC_008527  56408  57403  996  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsX  YP_808110  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0062  CDS  NC_008527  57506  58318  813  HAD superfamily hydrolase  YP_808111  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0063  CDS  NC_008527  58767  60404  1638  ABC transporter ATPase  YP_808112  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0064  CDS  NC_008527  60904  61158  255  hypothetical protein  YP_808113  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0065  CDS  NC_008527  61277  62101  825  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  YP_808114  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0066  CDS  NC_008527  62261  62842  582  transcriptional regulator  YP_808115  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0067  CDS  NC_008527  63030  63512  483  hypothetical protein  YP_808116  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0068  CDS  NC_008527  63769  65049  1281  O-acetylhomoserine sulfhydrylase  YP_808117  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0069  CDS  NC_008527  65315  66148  834  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  YP_808118  normal  0.367303  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0070  CDS  NC_008527  66497  67387  891  transposase  YP_808119  hitchhiker  0.00361102  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0071  CDS  NC_008527  67560  68027  468  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  YP_808120  hitchhiker  0.000663876  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0072  CDS  NC_008527  68154  68351  198  hypothetical protein  YP_808121  unclonable  1.37598e-06  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0073  CDS  NC_008527  68387  69007  621  esterase  YP_808122  unclonable  9.37464e-06  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0074  CDS  NC_008527  69075  70244  1170  lactoylglutathione lyase related lyase  YP_808123  unclonable  6.32777e-05  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0075  CDS  NC_008527  70255  70845  591  hypothetical protein  YP_808124  unclonable  4.47764e-06  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0076  CDS  NC_008527  70927  71076  150  50S ribosomal protein L33  YP_808125  unclonable  6.89148e-07  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0077  CDS  NC_008527  71106  71279  174  50S ribosomal protein L32  YP_808126  hitchhiker  1.37918e-05  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0078  CDS  NC_008527  71641  73422  1782  cation transport ATPase  YP_808127  normal  0.365296  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0079  CDS  NC_008527  73609  74088  480  hypothetical protein  YP_808128  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0080  CDS  NC_008527  74088  74456  369  hypothetical protein  YP_808129  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0081  CDS  NC_008527  74466  75251  786  chromosome segregation DNA-binding protein  YP_808130  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0082  CDS  NC_008527  75306  76565  1260  recombination factor protein RarA  YP_808131  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0083  CDS  NC_008527  76609  77097  489  acetyltransferase  YP_808132  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0084  CDS  NC_008527  77270  77737  468  hypothetical protein  YP_808133  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0085  CDS  NC_008527  77767  79320  1554  ABC transporter ATPase  YP_808134  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0086  CDS  NC_008527  79395  79679  285  hypothetical protein  YP_808135  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0087  CDS  NC_008527  79713  80453  741  SAM-dependent methyltransferase  YP_808136  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0088  CDS  NC_008527  80440  80928  489  hypothetical protein  YP_808137  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0089  CDS  NC_008527  80941  81894  954  ribosomal protein L11 methyltransferase  YP_808138  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0090  CDS  NC_008527  82014  82766  753  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  YP_808139  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0091  CDS  NC_008527  82796  83752  957  xylanase/chitin deacetylase  YP_808140  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0092  CDS  NC_008527  83953  86175  2223  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  YP_808141  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0093    NC_008527  86529  87124  596      normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0094  CDS  NC_008527  87382  87837  456  D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase  YP_808142  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0095  CDS  NC_008527  87830  88834  1005  hypothetical protein  YP_808143  normal  0.320202  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0096  CDS  NC_008527  88837  89460  624  HAD superfamily hydrolase  YP_808144  unclonable  1.47851e-05  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0097  CDS  NC_008527  89594  90991  1398  amino acid transporter  YP_808145  unclonable  0.000513472  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0098  CDS  NC_008527  91161  91802  642  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  YP_808146  normal  0.0626908  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0099  CDS  NC_008527  91833  92342  510  transcriptional regulator  YP_808147  normal  0.36846  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0100    NC_008527  92509  93152  644      normal  0.45819  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0101  CDS  NC_008527  93327  95924  2598  preprotein translocase subunit SecA  YP_808148  normal  0.17444  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0102  CDS  NC_008527  96054  97091  1038  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  YP_808149  normal  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0103  CDS  NC_008527  97340  97606  267  phosphocarrier protein HPr  YP_808150  normal  0.0536118  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0104  CDS  NC_008527  97609  99336  1728  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  YP_808151  normal  0.106099  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0105  CDS  NC_008527  99511  99819  309  hypothetical protein  YP_808152  hitchhiker  0.000345122  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0106  CDS  NC_008527  99909  100208  300  hypothetical protein  YP_808153  decreased coverage  3.96759e-05  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0107  CDS  NC_008527  100313  100600  288  serine hydroxymethyltransferase/phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase family protein  YP_808154  decreased coverage  3.4416e-05  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0109  CDS  NC_008527  100880  101815  936  alpha/beta fold family hydrolase  YP_808155  hitchhiker  0.000692138  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
LACR_0110  CDS  NC_008527  101956  102414  459  surface antigen  YP_808156  hitchhiker  0.000786434  n/a    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 28    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>