67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0027 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0027  phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component  100 
 
 		 607 aa  1216    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.03795  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001632  phosphotransferase system mannitol-specific  45.81 
 
 		 650 aa  475  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00834  PTS system, mannitol-specific II ABC component  45.63 
 
 		 650 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0196  PTS system, mannitol-specific IIABC component  46.01 
 
 		 649 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4447  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  48.11 
 
 		 635 aa  450  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4165  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  48.48 
 
 		 635 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4128  PTS system, mannitol-specific EIICBA component  50.1 
 
 		 643 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3780  PTS system mannitol-specific transporter subunit IIABC  50.1 
 
 		 643 aa  449  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0026  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  50.1 
 
 		 643 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0052  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  50.31 
 
 		 635 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.408793  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4004  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  50.1 
 
 		 657 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.852778  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1219  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  47.78 
 
 		 660 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0088  PTS system, mannitol-specific IIABC protein  49.9 
 
 		 628 aa  445  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0985  PTS system, mannitol-specific IIABC protein  49.9 
 
 		 469 aa  444  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.150194 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0113  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  48.8 
 
 		 637 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03454  fused mannitol-specific PTS enzymes: IIA components/IIB components/IIC components  46.89 
 
 		 637 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4016  PTS system, mannitol-specific IIABC component  48.8 
 
 		 637 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.659103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0072  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  47.77 
 
 		 639 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.337525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4969  PTS system, mannitol-specific IIABC component  48.8 
 
 		 637 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.873696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03405  hypothetical protein  46.89 
 
 		 637 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4098  PTS system, mannitol-specific IIABC component  48.8 
 
 		 637 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3806  PTS system, mannitol-specific IIABC component  46.89 
 
 		 637 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0107  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  46.89 
 
 		 637 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3932  PTS system, mannitol-specific IIABC component  48.8 
 
 		 637 aa  439  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.754882 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1252  mannitol-specific IIABC component, PTS system  47.89 
 
 		 625 aa  434  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000146575  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2813  PTS system, mannitol-specific EIICBA component  44.39 
 
 		 650 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2188  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  45.37 
 
 		 512 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2226  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  45.37 
 
 		 512 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0268  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  49.28 
 
 		 481 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0136  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  45.75 
 
 		 636 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5589  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  46.38 
 
 		 658 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4070  PTS system mannitol-specific transporter subunit EIICBA  48.15 
 
 		 638 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.293886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3901  pts system mannitol-specific eiicba component  48.15 
 
 		 638 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3963  PTS system mannitol-specific transporter subunit EIICBA  48.15 
 
 		 638 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.303673  normal  0.484856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4008  PTS system mannitol-specific eiicba component  48.15 
 
 		 638 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.32191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3885  pts system mannitol-specific eiicba component  48.15 
 
 		 638 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.816196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4768  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  46.36 
 
 		 508 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3789  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  48.15 
 
 		 676 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07060  phosphotransferase system, mannitol-specific IIBC component  48.13 
 
 		 687 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0054  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  46.42 
 
 		 512 aa  412  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0220  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  45.45 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3164  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2  43.61 
 
 		 668 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3834  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  43.06 
 
 		 478 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.826504  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1845  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  42.33 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02726  hypothetical protein  42.68 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0761  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  42.68 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02763  predicted fused mannitol-specific PTS enzymes: IIB component/IIC component  42.68 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3267  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component  42.68 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4234  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component  42.68 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0778  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  42.68 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0229075 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3365  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component  42.68 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3253  pts system mannitol-specific eiicba component  42.74 
 
 		 459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3320  PTS system mannitol-specific transporter subunit EIICBA  42.74 
 
 		 459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0659  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  39.51 
 
 		 436 aa  333  5e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4224  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  47.75 
 
 		 368 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.110658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7073  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  44.39 
 
 		 391 aa  325  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1525  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  48.14 
 
 		 356 aa  324  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.003101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2143  PTS systemmannitol-specific transporter subunit IIC  41.67 
 
 		 490 aa  323  7e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.678571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5271  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  49.35 
 
 		 397 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001413  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIBC subunit  42.66 
 
 		 420 aa  316  8e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.259327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3090  PTS system, mannitol-specific cryptic EIICB component, truncation  42.23 
 
 		 407 aa  316  9e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4849  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  49.52 
 
 		 406 aa  296  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0458  PTS system, mannitol-specific IIBC component  32.18 
 
 		 525 aa  252  2e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.646775  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0028  PTS system, mannitol-specific IIBC component, putative  31.21 
 
 		 517 aa  249  9e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1526  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  35.23 
 
 		 106 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.022737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5270  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  36.26 
 
 		 102 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4848  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  31.87 
 
 		 102 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>