More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0078 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0078  cation transport ATPase  100 
 
 
593 aa  1178    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.365296  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0180  heavy metal translocating P-type ATPase  51.65 
 
 
602 aa  604  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08040  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  43.75 
 
 
644 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585954  normal  0.130967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0240  heavy metal translocating P-type ATPase  44.38 
 
 
627 aa  497  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0340  heavy metal translocating P-type ATPase  41.26 
 
 
661 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2083  heavy metal translocating P-type ATPase  42.66 
 
 
658 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000592834 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1826  cation transport ATPase  41.32 
 
 
630 aa  458  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.296097  normal  0.0201631 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0917  heavy metal translocating P-type ATPase  43.99 
 
 
641 aa  448  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  36.73 
 
 
760 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.745522 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1352  cation transport ATPase  35.48 
 
 
719 aa  399  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1580  heavy metal translocating P-type ATPase  38.91 
 
 
626 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4621  heavy metal translocating P-type ATPase  38.12 
 
 
599 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1949  heavy metal translocating P-type ATPase  38.54 
 
 
618 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3027  heavy metal translocating P-type ATPase  38.49 
 
 
611 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4993  heavy metal translocating P-type ATPase  38.56 
 
 
775 aa  372  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1531  heavy metal translocating P-type ATPase  38.85 
 
 
626 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1234  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  38 
 
 
763 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1328  putative cation-transporting ATPase  36.7 
 
 
764 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3767  heavy metal translocating P-type ATPase  38.53 
 
 
780 aa  364  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5860  heavy metal translocating P-type ATPase  35.95 
 
 
763 aa  363  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.608727  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2249  heavy metal translocating P-type ATPase  35.12 
 
 
621 aa  362  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4372  heavy metal translocating P-type ATPase  37.74 
 
 
763 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4504  heavy metal translocating P-type ATPase  37.74 
 
 
763 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.500973 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0722  heavy metal translocating P-type ATPase  37.21 
 
 
759 aa  360  4e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000328227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6169  heavy metal translocating P-type ATPase  39.6 
 
 
776 aa  360  4e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4656  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 
616 aa  360  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.736872  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6248  heavy metal translocating P-type ATPase  37.84 
 
 
763 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.676922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1385  heavy metal translocating P-type ATPase  38.77 
 
 
775 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0387619  normal  0.88801 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8719  heavy metal translocating P-type ATPase  39.05 
 
 
802 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3442  putative cation-transporting ATPase  37.08 
 
 
765 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.913125  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1079  heavy metal translocating P-type ATPase  38.7 
 
 
774 aa  352  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1095  heavy metal translocating P-type ATPase  38.7 
 
 
774 aa  352  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.167715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1106  heavy metal translocating P-type ATPase  38.7 
 
 
774 aa  352  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966149  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0009  heavy metal translocating P-type ATPase  33.94 
 
 
743 aa  350  5e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220588 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1648  heavy metal translocating P-type ATPase  36.89 
 
 
764 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0284242  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6233  heavy metal translocating P-type ATPase  35.67 
 
 
737 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1303  heavy metal translocating P-type ATPase  35.27 
 
 
646 aa  326  6e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0933  heavy metal translocating P-type ATPase  35.09 
 
 
654 aa  321  3e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2012  heavy metal translocating P-type ATPase  34.77 
 
 
629 aa  318  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.442755  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4263  heavy metal translocating P-type ATPase  37.05 
 
 
791 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0323156  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0394  heavy metal translocating P-type ATPase  36.59 
 
 
641 aa  299  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207329  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3097  heavy metal translocating P-type ATPase  34.94 
 
 
670 aa  297  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0656722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3641  heavy metal translocating P-type ATPase  34.27 
 
 
656 aa  296  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0433  heavy metal translocating P-type ATPase  31 
 
 
786 aa  294  4e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2566  heavy metal translocating P-type ATPase  37.01 
 
 
642 aa  293  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  32.57 
 
 
639 aa  293  8e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2866  heavy metal translocating P-type ATPase  34.68 
 
 
655 aa  292  9e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  30.47 
 
 
723 aa  292  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0770  heavy metal translocating P-type ATPase  31.63 
 
 
699 aa  292  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  32.9 
 
 
699 aa  291  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0906  heavy metal translocating P-type ATPase  33.57 
 
 
712 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  32.58 
 
 
651 aa  290  7e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  33.64 
 
 
630 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2806  heavy metal translocating P-type ATPase  32.72 
 
 
806 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  33.72 
 
 
817 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  33.72 
 
 
817 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  32.16 
 
 
639 aa  286  8e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1162  heavy metal translocating P-type ATPase  32.33 
 
 
658 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5743  heavy metal translocating P-type ATPase  34.45 
 
 
655 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  32.65 
 
 
873 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  34.74 
 
 
818 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3179  heavy metal translocating P-type ATPase  34.22 
 
 
655 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0324717  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4803  heavy metal translocating P-type ATPase  36.66 
 
 
762 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457318  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0606  heavy metal translocating P-type ATPase  34.22 
 
 
655 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.72822  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0514  heavy metal translocating P-type ATPase  32.41 
 
 
633 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  32.6 
 
 
870 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5371  heavy metal translocating P-type ATPase  34.22 
 
 
652 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  31.25 
 
 
640 aa  282  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25770  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  33.71 
 
 
656 aa  281  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4476  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 
650 aa  282  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 
650 aa  282  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.823072  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4207  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 
650 aa  282  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  30.61 
 
 
707 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  32.28 
 
 
734 aa  281  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5294  heavy metal translocating P-type ATPase  34.04 
 
 
652 aa  281  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  31.8 
 
 
822 aa  281  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  30.24 
 
 
833 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3593  heavy metal translocating P-type ATPase  38.04 
 
 
637 aa  280  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  31.93 
 
 
869 aa  280  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  31.93 
 
 
851 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3681  heavy metal translocating P-type ATPase  34.17 
 
 
710 aa  280  6e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  31.76 
 
 
851 aa  280  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  31.97 
 
 
641 aa  280  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  31.97 
 
 
641 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  33.14 
 
 
814 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  31.97 
 
 
641 aa  279  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0336  heavy metal translocating P-type ATPase  28.34 
 
 
690 aa  279  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  34.51 
 
 
759 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  34.51 
 
 
759 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  31.98 
 
 
852 aa  279  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5318  heavy metal translocating P-type ATPase  34.6 
 
 
710 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.449789 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5693  heavy metal translocating P-type ATPase  34.6 
 
 
710 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  31.95 
 
 
753 aa  277  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3485  heavy metal translocating P-type ATPase  29.05 
 
 
740 aa  277  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333666  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0463  heavy metal translocating P-type ATPase  29.98 
 
 
724 aa  277  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  31.8 
 
 
641 aa  277  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  31.8 
 
 
641 aa  277  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1276  heavy metal translocating P-type ATPase  30.18 
 
 
786 aa  277  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2557  cadmium-translocating P-type ATPase  29.9 
 
 
629 aa  276  6e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00040081  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4430  heavy metal translocating P-type ATPase  33.1 
 
 
651 aa  276  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>