More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1949 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009671  Oant_4656  heavy metal translocating P-type ATPase  61.7 
 
 
616 aa  678    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.736872  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1949  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
618 aa  1206    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4621  heavy metal translocating P-type ATPase  58.03 
 
 
599 aa  614  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1303  heavy metal translocating P-type ATPase  56.3 
 
 
646 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5860  heavy metal translocating P-type ATPase  49.5 
 
 
763 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.608727  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0394  heavy metal translocating P-type ATPase  57.62 
 
 
641 aa  532  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207329  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6233  heavy metal translocating P-type ATPase  50.69 
 
 
737 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6248  heavy metal translocating P-type ATPase  49.67 
 
 
763 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.676922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2566  heavy metal translocating P-type ATPase  56.67 
 
 
642 aa  522  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6169  heavy metal translocating P-type ATPase  53.55 
 
 
776 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8719  heavy metal translocating P-type ATPase  53.21 
 
 
802 aa  514  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1328  putative cation-transporting ATPase  49.01 
 
 
764 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3442  putative cation-transporting ATPase  48.6 
 
 
765 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.913125  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2012  heavy metal translocating P-type ATPase  51.73 
 
 
629 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.442755  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0722  heavy metal translocating P-type ATPase  49.39 
 
 
759 aa  505  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000328227  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4504  heavy metal translocating P-type ATPase  47.75 
 
 
763 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.500973 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4372  heavy metal translocating P-type ATPase  47.75 
 
 
763 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2249  heavy metal translocating P-type ATPase  48.43 
 
 
621 aa  497  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3767  heavy metal translocating P-type ATPase  51.04 
 
 
780 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1234  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  48.17 
 
 
763 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1648  heavy metal translocating P-type ATPase  49.24 
 
 
764 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0284242  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3027  heavy metal translocating P-type ATPase  48.56 
 
 
611 aa  481  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  47.26 
 
 
760 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.745522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3593  heavy metal translocating P-type ATPase  54.97 
 
 
637 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1580  heavy metal translocating P-type ATPase  47.8 
 
 
626 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1079  heavy metal translocating P-type ATPase  47.19 
 
 
774 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1095  heavy metal translocating P-type ATPase  47.19 
 
 
774 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.167715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1106  heavy metal translocating P-type ATPase  47.19 
 
 
774 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966149  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4993  heavy metal translocating P-type ATPase  45.41 
 
 
775 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1385  heavy metal translocating P-type ATPase  47.33 
 
 
775 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0387619  normal  0.88801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08040  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  45.14 
 
 
644 aa  431  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585954  normal  0.130967 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0917  heavy metal translocating P-type ATPase  42.4 
 
 
641 aa  415  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2083  heavy metal translocating P-type ATPase  42.66 
 
 
658 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000592834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0340  heavy metal translocating P-type ATPase  41.48 
 
 
661 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1531  heavy metal translocating P-type ATPase  47.46 
 
 
626 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0240  heavy metal translocating P-type ATPase  42.63 
 
 
627 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4263  heavy metal translocating P-type ATPase  46.5 
 
 
791 aa  391  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0323156  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4803  heavy metal translocating P-type ATPase  47.64 
 
 
762 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457318  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0180  heavy metal translocating P-type ATPase  38.59 
 
 
602 aa  376  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0078  cation transport ATPase  38.54 
 
 
593 aa  368  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.365296  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1826  cation transport ATPase  34.62 
 
 
630 aa  342  1e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.296097  normal  0.0201631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0933  heavy metal translocating P-type ATPase  37 
 
 
654 aa  326  8.000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1352  cation transport ATPase  34.42 
 
 
719 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  42.68 
 
 
794 aa  318  3e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  35.96 
 
 
630 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20930  heavy metal translocating P-type ATPase  33.06 
 
 
745 aa  306  7e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000162182  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  34.6 
 
 
734 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0009  heavy metal translocating P-type ATPase  38.79 
 
 
743 aa  301  2e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  39.15 
 
 
868 aa  299  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  38.02 
 
 
782 aa  299  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  36.93 
 
 
801 aa  299  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1162  heavy metal translocating P-type ATPase  32.19 
 
 
658 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  37.43 
 
 
804 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  32.4 
 
 
737 aa  298  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 
755 aa  297  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  34.2 
 
 
707 aa  297  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  34.95 
 
 
737 aa  296  8e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0506  cation-transporting ATPase, P-type  30.78 
 
 
788 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.907696  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  37.19 
 
 
715 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0433  heavy metal translocating P-type ATPase  32.5 
 
 
786 aa  296  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0244  heavy metal translocating P-type ATPase  34.23 
 
 
707 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.787519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4704  heavy metal-transporting ATPase  30.78 
 
 
788 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0990671 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0876  heavy metal translocating P-type ATPase  35.96 
 
 
750 aa  295  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  39.27 
 
 
786 aa  295  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0512  heavy metal translocating P-type ATPase  31.24 
 
 
785 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  32.62 
 
 
751 aa  294  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  38.72 
 
 
773 aa  294  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0652  heavy metal-transporting ATPase  30.62 
 
 
788 aa  294  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  33.84 
 
 
738 aa  293  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  35.67 
 
 
824 aa  293  5e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  37.11 
 
 
818 aa  293  9e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0508  cation-transporting ATPase, P-type  30.46 
 
 
788 aa  292  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0510  cadmium-translocating P-type ATPase  31.11 
 
 
784 aa  292  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  35.85 
 
 
712 aa  291  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0723  heavy metal-transporting ATPase  32.26 
 
 
788 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1348  heavy metal translocating P-type ATPase  33.83 
 
 
643 aa  291  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0452174  normal  0.457159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  38.38 
 
 
1020 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5318  heavy metal translocating P-type ATPase  35.75 
 
 
710 aa  291  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.449789 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5693  heavy metal translocating P-type ATPase  35.75 
 
 
710 aa  291  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416286 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0663  heavy metal-transporting ATPase  31.11 
 
 
788 aa  290  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  38.17 
 
 
823 aa  291  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0634  heavy metal-transporting ATPase  30.46 
 
 
788 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.373732  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  34.02 
 
 
799 aa  290  4e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0564  heavy metal-transporting ATPase  31.11 
 
 
788 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0595  heavy metal-transporting ATPase  31.11 
 
 
788 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318271  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3681  heavy metal translocating P-type ATPase  36.33 
 
 
710 aa  290  7e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3504  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
743 aa  289  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  33.9 
 
 
889 aa  289  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0770  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 
699 aa  289  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  34.26 
 
 
735 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 
809 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0906  heavy metal translocating P-type ATPase  36.61 
 
 
712 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  34.69 
 
 
639 aa  287  4e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  34.29 
 
 
699 aa  287  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  34.8 
 
 
724 aa  287  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0087  heavy metal translocating P-type ATPase  33.27 
 
 
792 aa  287  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.908745  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  36.25 
 
 
711 aa  287  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  38.72 
 
 
793 aa  286  7e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2153  heavy metal translocating P-type ATPase  37.32 
 
 
724 aa  286  7e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00626662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1072  heavy metal translocating P-type ATPase  37.25 
 
 
755 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>