More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3767 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3767  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
780 aa  1491    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3442  putative cation-transporting ATPase  63.86 
 
 
765 aa  881    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.913125  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2249  heavy metal translocating P-type ATPase  60.76 
 
 
621 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1328  putative cation-transporting ATPase  64.66 
 
 
764 aa  920    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1234  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  47.66 
 
 
763 aa  620  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8719  heavy metal translocating P-type ATPase  49.52 
 
 
802 aa  611  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6169  heavy metal translocating P-type ATPase  48.98 
 
 
776 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4372  heavy metal translocating P-type ATPase  46.17 
 
 
763 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6248  heavy metal translocating P-type ATPase  47.91 
 
 
763 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.676922 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4504  heavy metal translocating P-type ATPase  46.17 
 
 
763 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.500973 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5860  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
763 aa  598  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.608727  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0722  heavy metal translocating P-type ATPase  44.64 
 
 
759 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000328227  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6233  heavy metal translocating P-type ATPase  45.89 
 
 
737 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4993  heavy metal translocating P-type ATPase  47.24 
 
 
775 aa  561  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  45.26 
 
 
760 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.745522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1385  heavy metal translocating P-type ATPase  47.04 
 
 
775 aa  545  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0387619  normal  0.88801 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1949  heavy metal translocating P-type ATPase  50.08 
 
 
618 aa  542  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1648  heavy metal translocating P-type ATPase  46.66 
 
 
764 aa  544  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0284242  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4263  heavy metal translocating P-type ATPase  49.66 
 
 
791 aa  544  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0323156  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1079  heavy metal translocating P-type ATPase  46.98 
 
 
774 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1106  heavy metal translocating P-type ATPase  46.98 
 
 
774 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966149  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1095  heavy metal translocating P-type ATPase  46.98 
 
 
774 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.167715 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3027  heavy metal translocating P-type ATPase  53.55 
 
 
611 aa  509  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4621  heavy metal translocating P-type ATPase  48.08 
 
 
599 aa  504  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4656  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
616 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.736872  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1303  heavy metal translocating P-type ATPase  51.46 
 
 
646 aa  485  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1580  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
626 aa  475  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4803  heavy metal translocating P-type ATPase  46.25 
 
 
762 aa  466  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457318  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08040  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  48.67 
 
 
644 aa  462  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585954  normal  0.130967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2012  heavy metal translocating P-type ATPase  51.89 
 
 
629 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.442755  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0394  heavy metal translocating P-type ATPase  51.31 
 
 
641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207329  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2083  heavy metal translocating P-type ATPase  49.16 
 
 
658 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000592834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1531  heavy metal translocating P-type ATPase  50.44 
 
 
626 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2566  heavy metal translocating P-type ATPase  52.76 
 
 
642 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0340  heavy metal translocating P-type ATPase  43.12 
 
 
661 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0240  heavy metal translocating P-type ATPase  45.48 
 
 
627 aa  429  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0917  heavy metal translocating P-type ATPase  43.83 
 
 
641 aa  428  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  43.84 
 
 
794 aa  411  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0180  heavy metal translocating P-type ATPase  38.74 
 
 
602 aa  402  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3593  heavy metal translocating P-type ATPase  52.23 
 
 
637 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0078  cation transport ATPase  38.17 
 
 
593 aa  390  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.365296  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1826  cation transport ATPase  35.44 
 
 
630 aa  363  5.0000000000000005e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.296097  normal  0.0201631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0933  heavy metal translocating P-type ATPase  38.27 
 
 
654 aa  341  2.9999999999999998e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1352  cation transport ATPase  35.41 
 
 
719 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0009  heavy metal translocating P-type ATPase  38.69 
 
 
743 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220588 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  36.65 
 
 
734 aa  306  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0433  heavy metal translocating P-type ATPase  33.57 
 
 
786 aa  301  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0770  heavy metal translocating P-type ATPase  34.58 
 
 
699 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4704  heavy metal-transporting ATPase  33.04 
 
 
788 aa  300  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0990671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  34.03 
 
 
707 aa  300  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0634  heavy metal-transporting ATPase  33.04 
 
 
788 aa  300  6e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.373732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0508  cation-transporting ATPase, P-type  32.98 
 
 
788 aa  300  7e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0652  heavy metal-transporting ATPase  32.98 
 
 
788 aa  300  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329605 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0506  cation-transporting ATPase, P-type  32.81 
 
 
788 aa  298  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.907696  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4430  heavy metal translocating P-type ATPase  37.11 
 
 
651 aa  296  7e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  33.15 
 
 
630 aa  296  8e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0244  heavy metal translocating P-type ATPase  31.37 
 
 
707 aa  296  8e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.787519  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  35.07 
 
 
682 aa  293  6e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  35.65 
 
 
834 aa  293  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1162  heavy metal translocating P-type ATPase  33.03 
 
 
658 aa  293  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1276  heavy metal translocating P-type ATPase  33.39 
 
 
786 aa  291  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0723  heavy metal-transporting ATPase  32.47 
 
 
788 aa  291  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  32.2 
 
 
822 aa  290  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  32.66 
 
 
751 aa  290  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  34.08 
 
 
647 aa  290  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0512  heavy metal translocating P-type ATPase  31.85 
 
 
785 aa  290  9e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0663  heavy metal-transporting ATPase  32.47 
 
 
788 aa  289  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0564  heavy metal-transporting ATPase  32.64 
 
 
788 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0595  heavy metal-transporting ATPase  32.64 
 
 
788 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318271  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1839  heavy metal translocating P-type ATPase  34.59 
 
 
625 aa  288  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.207467  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20930  heavy metal translocating P-type ATPase  33.09 
 
 
745 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000162182  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  36.47 
 
 
793 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  34.08 
 
 
833 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  34.67 
 
 
737 aa  286  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 
835 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0510  cadmium-translocating P-type ATPase  32.64 
 
 
784 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
712 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  33.64 
 
 
641 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  39.71 
 
 
1020 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.020179  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  36.14 
 
 
817 aa  284  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  33.45 
 
 
835 aa  284  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  38.5 
 
 
823 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  35.28 
 
 
750 aa  283  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  36.18 
 
 
792 aa  283  9e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7296  cadmium-exporting ATPase  34.64 
 
 
842 aa  282  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212618  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0343  cadmium efflux ATPase  33.91 
 
 
645 aa  282  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1662  heavy metal translocating P-type ATPase  37.79 
 
 
656 aa  282  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805882  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  33.17 
 
 
640 aa  281  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  35.37 
 
 
713 aa  281  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
816 aa  281  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4834  heavy metal translocating P-type ATPase  40.69 
 
 
796 aa  280  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.311359  normal  0.100077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  32.72 
 
 
641 aa  280  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  37.76 
 
 
639 aa  280  9e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  35.04 
 
 
724 aa  280  9e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1742  cadmium-translocating P-type ATPase  31.24 
 
 
773 aa  280  9e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.106711  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  34.08 
 
 
797 aa  279  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4476  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 
650 aa  280  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 
650 aa  280  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.823072  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4207  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 
650 aa  280  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  38.69 
 
 
755 aa  279  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>