More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0009 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0009  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 743 aa  1520    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220588 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1352  cation transport ATPase  47.64 
 
 		 719 aa  618  1e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0340  heavy metal translocating P-type ATPase  37.2 
 
 		 661 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0240  heavy metal translocating P-type ATPase  36.87 
 
 		 627 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0180  heavy metal translocating P-type ATPase  42.6 
 
 		 602 aa  351  2e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0917  heavy metal translocating P-type ATPase  40.66 
 
 		 641 aa  348  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2083  heavy metal translocating P-type ATPase  41.7 
 
 		 658 aa  342  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000592834 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0078  cation transport ATPase  33.94 
 
 		 593 aa  335  1e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.365296  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08040  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  42.8 
 
 		 644 aa  336  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585954  normal  0.130967 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1826  cation transport ATPase  38.42 
 
 		 630 aa  305  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.296097  normal  0.0201631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4993  heavy metal translocating P-type ATPase  36.26 
 
 		 775 aa  303  9e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1949  heavy metal translocating P-type ATPase  38.79 
 
 		 618 aa  301  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4621  heavy metal translocating P-type ATPase  38.34 
 
 		 599 aa  300  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1234  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.65 
 
 		 763 aa  293  8e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2249  heavy metal translocating P-type ATPase  35.57 
 
 		 621 aa  293  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  36.54 
 
 		 760 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.745522 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3767  heavy metal translocating P-type ATPase  38.58 
 
 		 780 aa  290  8e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3027  heavy metal translocating P-type ATPase  36.47 
 
 		 611 aa  288  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5860  heavy metal translocating P-type ATPase  36.72 
 
 		 763 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1648  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 		 764 aa  287  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0284242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4504  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 763 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.500973 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4372  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 763 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1328  putative cation-transporting ATPase  35.7 
 
 		 764 aa  284  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6169  heavy metal translocating P-type ATPase  38.09 
 
 		 776 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4263  heavy metal translocating P-type ATPase  37.85 
 
 		 791 aa  282  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0323156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8719  heavy metal translocating P-type ATPase  37.86 
 
 		 802 aa  282  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0722  heavy metal translocating P-type ATPase  34.91 
 
 		 759 aa  277  5e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000328227  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4656  heavy metal translocating P-type ATPase  37.25 
 
 		 616 aa  277  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.736872  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1580  heavy metal translocating P-type ATPase  36.14 
 
 		 626 aa  277  6e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1531  heavy metal translocating P-type ATPase  37 
 
 		 626 aa  275  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0933  heavy metal translocating P-type ATPase  35.32 
 
 		 654 aa  273  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3442  putative cation-transporting ATPase  34.91 
 
 		 765 aa  271  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.913125  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  34.63 
 
 		 818 aa  271  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1079  heavy metal translocating P-type ATPase  36.41 
 
 		 774 aa  269  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1106  heavy metal translocating P-type ATPase  36.41 
 
 		 774 aa  269  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1095  heavy metal translocating P-type ATPase  36.41 
 
 		 774 aa  269  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.167715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1385  heavy metal translocating P-type ATPase  37.47 
 
 		 775 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0387619  normal  0.88801 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  33.14 
 
 		 682 aa  267  5e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6233  heavy metal translocating P-type ATPase  35.43 
 
 		 737 aa  266  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6248  heavy metal translocating P-type ATPase  35.36 
 
 		 763 aa  263  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.676922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2012  heavy metal translocating P-type ATPase  37.72 
 
 		 629 aa  262  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.442755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  35.81 
 
 		 792 aa  263  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0433  heavy metal translocating P-type ATPase  36.12 
 
 		 786 aa  259  9e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  34.05 
 
 		 815 aa  259  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  38.2 
 
 		 794 aa  256  8e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0512  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 785 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  32.32 
 
 		 889 aa  254  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  32.39 
 
 		 799 aa  254  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4704  heavy metal-transporting ATPase  33.91 
 
 		 788 aa  253  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0990671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  35.25 
 
 		 651 aa  253  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2557  cadmium-translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 629 aa  253  6e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00040081  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  32.51 
 
 		 889 aa  254  6e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0634  heavy metal-transporting ATPase  33.91 
 
 		 788 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.373732  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  32.8 
 
 		 804 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0506  cation-transporting ATPase, P-type  33.91 
 
 		 788 aa  253  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.907696  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0508  cation-transporting ATPase, P-type  33.91 
 
 		 788 aa  253  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0652  heavy metal-transporting ATPase  33.91 
 
 		 788 aa  253  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329605 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0121  heavy metal translocating P-type ATPase  34.34 
 
 		 616 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000385765  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  34.35 
 
 		 794 aa  251  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2654  heavy metal translocating P-type ATPase  35.05 
 
 		 654 aa  251  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.18472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1276  heavy metal translocating P-type ATPase  36.43 
 
 		 786 aa  250  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  35.37 
 
 		 793 aa  249  9e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0770  heavy metal translocating P-type ATPase  33.2 
 
 		 699 aa  249  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  34.86 
 
 		 792 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1303  heavy metal translocating P-type ATPase  36.58 
 
 		 646 aa  248  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1162  heavy metal translocating P-type ATPase  33.2 
 
 		 658 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  32.77 
 
 		 631 aa  247  6e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000372175  normal  0.539461 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 798 aa  247  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0723  heavy metal-transporting ATPase  33.78 
 
 		 788 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  34.81 
 
 		 797 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4803  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 762 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457318  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  34.66 
 
 		 792 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  31.77 
 
 		 743 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0510  cadmium-translocating P-type ATPase  33.78 
 
 		 784 aa  245  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0244  heavy metal translocating P-type ATPase  34.31 
 
 		 707 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.787519  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19630  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  34.72 
 
 		 656 aa  244  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00267622  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0663  heavy metal-transporting ATPase  33.59 
 
 		 788 aa  244  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0564  heavy metal-transporting ATPase  33.4 
 
 		 788 aa  243  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0595  heavy metal-transporting ATPase  33.4 
 
 		 788 aa  243  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  33.59 
 
 		 806 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  31.29 
 
 		 817 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  31.29 
 
 		 817 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0876  heavy metal translocating P-type ATPase  33.47 
 
 		 750 aa  241  4e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20930  heavy metal translocating P-type ATPase  32.42 
 
 		 745 aa  240  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000162182  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13740  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  34.7 
 
 		 638 aa  239  9e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  31.42 
 
 		 814 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  31.26 
 
 		 797 aa  239  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  32.58 
 
 		 894 aa  239  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  34 
 
 		 707 aa  239  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  33.2 
 
 		 806 aa  238  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0927  heavy metal translocating P-type ATPase  35.19 
 
 		 800 aa  238  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.28162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  33.47 
 
 		 796 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  32.67 
 
 		 790 aa  237  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0234  cadmium-translocating P-type ATPase  32.26 
 
 		 618 aa  237  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00321637  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  32.13 
 
 		 821 aa  236  8e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10590  copper/silver-translocating P-type ATPase  33.53 
 
 		 755 aa  236  9e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11171  normal  0.524998 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  33.2 
 
 		 805 aa  236  9e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  33.2 
 
 		 805 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  33.2 
 
 		 805 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  33.2 
 
 		 805 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>