More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3295 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
639 aa  1242    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1801  heavy metal translocating P-type ATPase  56.83 
 
 
639 aa  580  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0762097  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  55.06 
 
 
639 aa  579  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  54.72 
 
 
679 aa  568  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  52.5 
 
 
628 aa  562  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1662  heavy metal translocating P-type ATPase  56.38 
 
 
656 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805882  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24490  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  54.77 
 
 
667 aa  543  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2339  heavy metal translocating P-type ATPase  51.64 
 
 
643 aa  534  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0721  cadmium-translocating P-type ATPase  54.06 
 
 
646 aa  519  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000381193 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0348  cation transport ATPase  42.04 
 
 
634 aa  499  1e-140  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00293849  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1042  cation transport ATPase  41.87 
 
 
620 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0059101  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A03  cation transport ATPase  39.97 
 
 
616 aa  463  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0981  cation transport ATPase  38.42 
 
 
633 aa  462  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
783 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  40.38 
 
 
767 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  41.01 
 
 
751 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  40.16 
 
 
833 aa  411  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  40.78 
 
 
850 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  41.99 
 
 
673 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  41.02 
 
 
825 aa  404  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  39.75 
 
 
640 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  38.28 
 
 
785 aa  402  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  37.44 
 
 
712 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  43.9 
 
 
824 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  37.18 
 
 
712 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  42.01 
 
 
713 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  39.49 
 
 
752 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  37.81 
 
 
677 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  41.04 
 
 
635 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  42.56 
 
 
800 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  40.84 
 
 
799 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  41.3 
 
 
707 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  37.54 
 
 
712 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  38.12 
 
 
735 aa  393  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 
868 aa  394  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  39.52 
 
 
752 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  40.31 
 
 
738 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  41.8 
 
 
769 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  38.54 
 
 
812 aa  392  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  42.38 
 
 
734 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  44.92 
 
 
728 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  43.86 
 
 
742 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  44.92 
 
 
728 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  39.38 
 
 
939 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  41.35 
 
 
748 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  43.78 
 
 
712 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  41.41 
 
 
984 aa  388  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  41.41 
 
 
984 aa  388  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  41.11 
 
 
750 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  40.82 
 
 
750 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  41.52 
 
 
678 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3562  heavy metal translocating P-type ATPase  42.02 
 
 
762 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482767  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  40.64 
 
 
800 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  40.49 
 
 
835 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  40.1 
 
 
739 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  40.64 
 
 
800 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0343  cadmium efflux ATPase  37.38 
 
 
645 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  42.18 
 
 
750 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  39.72 
 
 
750 aa  383  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  39.27 
 
 
798 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  42.88 
 
 
737 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  40.42 
 
 
791 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  40.92 
 
 
750 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  40.03 
 
 
835 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  38.49 
 
 
723 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  39.14 
 
 
805 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.53 
 
 
709 aa  382  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
833 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  42.63 
 
 
800 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  42.63 
 
 
800 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  40.36 
 
 
799 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
1022 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 
801 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  42.29 
 
 
827 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  41.4 
 
 
726 aa  378  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  41.77 
 
 
701 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  39.6 
 
 
833 aa  378  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  41.64 
 
 
734 aa  378  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  39.4 
 
 
806 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  39.4 
 
 
806 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  41.03 
 
 
814 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  42.06 
 
 
836 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  38.51 
 
 
822 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  42.04 
 
 
812 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  39.86 
 
 
726 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  36.18 
 
 
630 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  39.6 
 
 
797 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  38.49 
 
 
805 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0186  heavy metal translocating P-type ATPase  43.32 
 
 
670 aa  373  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  39.25 
 
 
834 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  42.06 
 
 
836 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  41.53 
 
 
800 aa  375  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  38.49 
 
 
805 aa  372  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  39.63 
 
 
857 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 
748 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  39.23 
 
 
734 aa  372  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  37.79 
 
 
760 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1461  heavy metal translocating P-type ATPase  40.93 
 
 
768 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1481  heavy metal translocating P-type ATPase  40.93 
 
 
768 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180195  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4001  heavy metal translocating P-type ATPase  42.23 
 
 
745 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.703594  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>