21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0080 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0080  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  246  9e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0483  hypothetical protein  42.86 
 
 
252 aa  55.1  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1471  hypothetical protein  36.84 
 
 
395 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000124905  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2739  hypothetical protein  50.88 
 
 
257 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00573503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8898  protein of unknown function DUF347  36.26 
 
 
266 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4177  hypothetical protein  36.26 
 
 
319 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1548  hypothetical protein  38.89 
 
 
300 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.785401 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1967  protein of unknown function DUF347  51.72 
 
 
264 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2330  hypothetical protein  51.72 
 
 
264 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551735  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2371  hypothetical protein  37.5 
 
 
424 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3455  hypothetical protein  32.29 
 
 
262 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.093168  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5041  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.737372  normal  0.404949 
 
 
-
 
NC_003296  RS03008  hypothetical protein  31.96 
 
 
260 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3899  hypothetical protein  36.14 
 
 
269 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5567  hypothetical protein  27.36 
 
 
252 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1393  hypothetical protein  38.03 
 
 
262 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.770613  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2113  protein of unknown function DUF347  33.33 
 
 
252 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2596  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0502433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3003  hypothetical protein  31.58 
 
 
252 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4038  putative MFS superfamily permease  31.58 
 
 
252 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4979  putative MFS superfamily permease  31.58 
 
 
252 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.547369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>