More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0106 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  199  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  51.04 
 
 		 102 aa  104  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1747  hypothetical protein  55.06 
 
 		 99 aa  101  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0369  hypothetical protein  50.55 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194177 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1560  hypothetical protein  55.06 
 
 		 99 aa  101  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  48.45 
 
 		 118 aa  94.4  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  46.39 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  46.39 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  44.33 
 
 		 108 aa  87.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  39.58 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  41.67 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  44.94 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  40.62 
 
 		 100 aa  80.1  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4009  hypothetical protein  40.62 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.765545  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  39.8 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  40.43 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  40.86 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  38.95 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  42.27 
 
 		 103 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  38.54 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  39.8 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  39.39 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  37.11 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  37.11 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  37.11 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  35.35 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  36.84 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  39.39 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  39.39 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  37.89 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  34.02 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  42.11 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  38.95 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  37.5 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0214  hypothetical protein  44.94 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  41.05 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  34.74 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  38.95 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  38.95 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  37.89 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  37.89 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  34.02 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  38.14 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  35.11 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  36.08 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  36.46 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  35.79 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  37.93 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  36.73 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf159  hypothetical protein  38.71 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  38.14 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  37.89 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  34.02 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  37.89 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  37.89 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  37.89 
 
 		 109 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  34.02 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  37.89 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  37.89 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  37.89 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  34.74 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  39.58 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  41.57 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  37.89 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1612  hypothetical protein  42.17 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.062736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  35.79 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  35.79 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  34.78 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  33.65 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  33.65 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  35.79 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0645  hypothetical protein  35.42 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2014  hypothetical protein  37.89 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1806  hypothetical protein  41.84 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.584307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  34.34 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  38.95 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  37.11 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  33.68 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  34.38 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  37.89 
 
 		 111 aa  67  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  35.79 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  35.79 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  41.56 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  35.79 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  35.79 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  39.58 
 
 		 102 aa  67  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  35.79 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  35.79 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  35.79 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  35.79 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  35.79 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  30.93 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  35.79 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  35.79 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>