170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0012 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0012  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  100 
 
 		 89 aa  172  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0008  S4 domain-containing protein  75 
 
 		 91 aa  131  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.340534  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0010  S4 domain-containing protein  73.81 
 
 		 90 aa  130  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0055  S4 domain-containing protein  66.67 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.28078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0056  S4 domain-containing protein  66.67 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0052  heat shock protein 15  66.67 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000120975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0052  heat shock protein 15  66.67 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0062  S4 domain protein  66.67 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.244767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0063  S4 domain protein  66.67 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0056  s4 domain-containing protein  66.67 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5254  S4 domain protein  66.67 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0066  S4 domain protein  66.67 
 
 		 91 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0453623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  66.67 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0400  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  66.67 
 
 		 93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0052  RNA-binding S4 domain protein  64.04 
 
 		 93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0052  RNA-binding S4 domain-containing protein  64.37 
 
 		 91 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.052055  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0054  RNA-binding S4 domain protein  64.29 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0449701  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0144  S4 domain-containing protein  57.47 
 
 		 87 aa  105  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0184  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  59.26 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0263  RNA-binding S4 domain-containing protein  60.98 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0688  RNA-binding S4 domain-containing protein  64.2 
 
 		 81 aa  99.4  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0948167  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0528  RNA-binding S4 domain-containing protein  63.16 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000233006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0541  RNA-binding S4 domain-containing protein  63.16 
 
 		 87 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000262722  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0272  ribosome-associated heat shock protein implicated in the recycling of the 50S subunit S4-like protein  60.76 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2801  S4 domain-containing protein  58.23 
 
 		 86 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000568506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2487  S4 domain-containing protein  56.96 
 
 		 86 aa  93.6  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000325164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3084  RNA-binding S4 domain protein  55.13 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000350444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0134  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.96 
 
 		 79 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0649  RNA-binding S4 domain protein  48.1 
 
 		 80 aa  87  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000916676  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2658  RNA-binding S4  53.95 
 
 		 79 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000195193  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0187  RNA-binding S4 domain protein  50.63 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0116  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.1 
 
 		 80 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0084  hypothetical protein  49.37 
 
 		 80 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0093  RNA-binding S4 domain protein  51.85 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000415805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0220  RNA-binding S4 domain protein  42.86 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0620  RNA-binding S4 domain protein  50.62 
 
 		 81 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0076  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.18 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0086  RNA-binding S4  45.68 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0510355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0136  RNA-binding S4 domain protein  41.77 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0965  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.24 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1221  RNA-binding S4 domain protein  35.63 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000180321  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1262  RNA-binding S4 domain protein  46.67 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1380  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.37 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.278565  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0164  S4 domain protein  37.5 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0343  RNA-binding S4 domain protein  37.5 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.703045 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2068  RNA-binding S4 domain protein  41.98 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  37.35 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.14 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.14 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3813  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  36.14 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0176  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.18 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.905823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3737  heat shock protein 15  37.18 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3976  heat shock protein 15  37.18 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1237  uroporphyrinogen decarboxylase  47.06 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0142  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.18 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.28 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4615  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.46 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0725  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.48 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0701  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.48 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00584893  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3625  putative heat shock protein  38.46 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0753  S4 RNA-binding domain protein  43.14 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4071  RNA-binding S4 domain protein  41.51 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0228  RNA-binding S4  34.94 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3894  RNA-binding S4 domain protein  39.62 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  36.67 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.67 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0850  S4 domain-containing protein  42.86 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00127812  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  42.31 
 
 		 141 aa  48.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0119  RNA-binding S4  32.18 
 
 		 132 aa  48.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0359647  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1066  S4 domain-containing protein  39.22 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3696  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.94 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0693  S4 domain-containing protein  41.18 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0717  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.67 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1980  S4 domain-containing protein  43.14 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0313  RNA-binding S4 domain protein  34.94 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0734  RNA-binding S4 domain protein  27.78 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0768  S4 domain-containing protein  41.18 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3769  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.94 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3803  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.94 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0490537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  44.23 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3694  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.94 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  40.43 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0103  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.53 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3778  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.94 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3678  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.94 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479283 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0313  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.94 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0933812 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3866  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.94 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4705  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.94 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.39239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1332  S4 domain-containing protein  41.18 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3596  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.94 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3872  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  34.94 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2104  RNA-binding S4 domain protein  36.92 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  36.36 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0154  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.94 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.29084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0328  RNA-binding S4 domain protein  33.33 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  35 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.15 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3569  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.15 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0348447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  35 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4593  heat shock protein 15  36.14 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>